點擊化學是一種多功能反應(yīng),可用于合成各種綴合物。事實上,任何生物分子都可以使用點擊化學方法輕松地用小分子標記,例如熒光染料、生物素等。
點擊化學反應(yīng)發(fā)生在兩種組分之間: 疊氮化物和炔烴(末端乙炔)。疊氮基和炔基在天然生物分子中幾乎從未遇到過。因此,該反應(yīng)具有高度生物正交性和特異性。如果需要標記寡 核苷酸,可以在許多定制寡核苷酸合成設(shè)施和公司訂購炔烴修飾的寡核苷酸。
使用下表計算點擊化學標記所需的試劑體積。準備所需的儲備溶液(見附錄)。
試劑 混合物中的最終濃度 原液濃度 炔烴修飾寡核苷酸 變化(20 — 200 uM) 各不相同 疊氮化物 1.5 x(寡核苷酸濃度) 10 mM DMSO 溶液 二甲基亞砜 50體積% — 抗壞血酸 0.5毫米 5 mM 水中 銅-TBTA絡(luò)合物 0.5毫米 10 mM,溶于 55 vol% DMSO 將炔烴修飾的寡核苷酸或 DNA溶解在耐壓小瓶中的水中。
添加2M 醋酸三乙銨緩沖液(pH 7.0)至終濃度 0.2 M。
添加DMSO,并渦旋。
添加疊氮化物儲備溶液(DMSO 中的 10 mM),并渦旋。
將所需體積的 5mM 抗壞血酸儲備溶液添加到混合物中,并短暫渦旋。
通過向其中鼓泡惰性氣體 30 秒來對溶液進行脫氣。可以使用氮氣、氬氣或氦氣。
將所需量的 10 mM 銅 (II)-TBTA 庫存在 55% DMSO 中添加到混合物中。用惰性氣體沖洗小瓶并蓋上蓋子。
渦旋混合物。如果觀察到明顯的疊氮化物沉淀,則將小瓶在 80°C 下加熱 3 分鐘,然后渦旋。
在室溫下保存過夜。
用丙酮(對于寡核苷酸)或乙醇(對于 DNA)沉淀結(jié)合物。
沉淀寡核苷酸綴合物:
向混合物中添加至少 4 倍過量體積的 3% 高氯酸鋰丙酮溶液(如果混合物體積很大,則分成幾個小瓶)。
沉淀 DNA 綴合物:
向混合物中添加乙酸鈉至終濃度0.3M;
添加 2.5 體積的乙醇(或 0.8 體積的異丙醇)。
充分混合并在-20°C下保持20分鐘。
10000 rpm 離心 10 分鐘。
丟棄上清液。
用丙酮 (1 mL) 洗滌沉淀,以 10000 rpm 離心 10 分鐘。
棄去上清液,干燥沉淀,并通過 RP-HPLC 或 PAGE 純化綴合物。
相關(guān)產(chǎn)品
免責聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權(quán)行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負版權(quán)等法律責任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。