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代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析方法和策略
代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析方法和策略
獲得代謝組學(xué)數(shù)據(jù)后，需要利用軟件讀取并分析原始數(shù)據(jù)的信息，以確定原始數(shù)據(jù)中所含代謝成分的組成和含量。有許多統(tǒng)計(jì)軟件可以讀取和分析核磁共振譜和質(zhì)譜數(shù)據(jù)。 XCMS 是一款常用的免費(fèi)軟件，用于讀取和分析質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)。類似的常用軟件還有MZmine2、MetAlign、MathDAMP、LCMStats等。
一旦獲得代謝物組成和含量，就可以對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。常用的分析方法包括主成分分析(PCA)、偏最小二乘回歸、聚類分析、差異表達(dá)分析等。結(jié)果還可以利用上述數(shù)據(jù)庫進(jìn)行功能和通路富集分析。
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