DNA提取的類型與基本原則
核酸提取通常是開啟生物學研究的第一步,而且提取的核酸質(zhì)量高低也是決定下游實驗成敗的關鍵因素之一,那么你知道DNA提取的類型與基本原則是什么嗎?讓我們一起來看看吧!
一、核酸提取類型:
1.總RNA提取
總RNA中,75-85%為rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、5S rRNA、5.8S rRNA、miRNA、siRNA、小核RNA及核仁小分子RNA等組成。
2.miRNA提取
MicroRNAs(miRNAs)是小型的、高度保守的RNA分子,如小干擾RNAs(siRNAs),通過與他們的堿基配對調(diào)節(jié)其同源mRNA的分子表達,以預防通過各種機制的表達。他們已成為進行發(fā)育、細胞增殖、分化和細胞周期的重點監(jiān)管機構。
3.基因組DNA提取
進行基因結(jié)構和功能研究以及基因診斷,通常要求得到的片段長度不小于100~200kb。在DNA提取過程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為后續(xù)的實驗打下基礎。
4.質(zhì)粒抽提
質(zhì)粒抽提方法即去除RNA,將質(zhì)粒與細菌基因組DNA分開,去除蛋白質(zhì)及其它雜質(zhì),以得到相對純凈的質(zhì)粒。
二、DNA提取的基本原則
1.保證DNA結(jié)構的完整性
不同的下游實驗對于DNA結(jié)構的完整性有所區(qū)別。如PCR、Southern雜交這一類實驗基本保證所需片段的完整,而二代測序?qū)嶒灋榱双@得全面的序列信息對DNA的完整性要求更高。
2.保證DNA的純度
去除對下游實驗中酶分子有抑制作用的有機溶劑和高濃度金屬離子,將蛋白質(zhì)、多糖、多酚等生物大分子的污染降到低,去除其他核酸。
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