cfDNA 的分離、定量和評(píng)估并不是一項(xiàng)簡(jiǎn)單的任務(wù)。它需要敏感且可靠的工作流程。
cfDNA 是一種極其難以處理的樣品類(lèi)型,因?yàn)?cfDNA 的產(chǎn)量通常有限且高度碎片化。這就是 MagVigen™ cfDNA 提取試劑盒(貨號(hào) #K61003)發(fā)揮作用的地方。它可以為 NGS 檢測(cè)提供更高產(chǎn)量和更高質(zhì)量的 cfDNA 樣本(相對(duì)于 Qiagen 試劑盒)。
cfDNA 提取工作流程
1.溶解:溶解等離子體樣品。
2.結(jié)合和捕獲:將 MagVigen™ 納米顆粒與樣品混合。納米顆粒與 cfDNA 片段結(jié)合。
3.沉淀和重新分散 1:磁性沉淀珠子直至溶液澄清。珠子響應(yīng)磁力(通過(guò)使用磁鐵,例如磁力分離架),使結(jié)合的材料能夠快速有效地與樣品的其余部分分離。通過(guò)抽吸除去上清液(未結(jié)合的材料),剩下的是納米顆粒結(jié)合的目標(biāo)。然后將珠粒重新分散在洗滌 1 緩沖液中。
4.轉(zhuǎn)移:將洗滌 1 溶液轉(zhuǎn)移至 1.5 或 2ml 管中。
5.沉淀和重新分散 2:磁力沉淀,按照步驟 3 去除上清液。這次將珠粒重新分散在 75% 乙醇中。
6.清洗和沉淀 2,3:使用 75% 乙醇清洗珠粒。將珠子沉淀并除去所有上清液。將珠粒重新分散在 75% 乙醇中。執(zhí)行此步驟兩次。
7.洗脫:高質(zhì)量 cfDNA 的最終洗脫。為下游 NGS、PCR 或其他應(yīng)用做好準(zhǔn)備。
2次洗脫有助于提高cfDNA產(chǎn)量。
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