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產(chǎn)品升級 | 新一代FFPE DNA提取試劑盒助力提高突變檢出率
FFPE樣本-腫瘤病理研究和分子診斷的金標(biāo)準(zhǔn)！
FFPE(Formalin-fixed,paraffin-embedding)，一般指人類或者動植物組織樣本經(jīng)福爾馬林(目前應(yīng)用最為廣泛的固定劑為10%中性福爾馬林)固定，石蠟包埋形成的切片或石蠟塊。這種方式是目前長期保存病理樣本的標(biāo)準(zhǔn)化方法。
福爾馬林固定、石蠟包埋 (FFPE) 組織切片代表了珍貴的生物醫(yī)學(xué)研究材料。FFPE樣本堪稱為病理科的“瑰寶”，它們承載著眾多的疾病信息。
圖1.FFPE樣本
FFPE樣本的制備
FFPE樣本提取難點(diǎn)
翌圣生物通過不斷地打磨，將FFPE樣本DNA提取的性能全面升級，采用的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系，面對不同降解程度的FFPE DNA片段，可最大限度的分離純化高純度DNA，同時可適配自動化提取儀，讓提取如此簡單！
產(chǎn)品介紹
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit （Cat#18375ES）適用于福爾馬林固定、石蠟包埋的組織中提取 DNA，可配合翌圣3種不同通量的自動化提取儀Auto-Pure32A/AP-48/AP-96，實現(xiàn)核酸的高通量提取。
圖2：FFPE DNA的提取流程
產(chǎn)品優(yōu)勢
提取得率高：提取的基因組完整性好、純度高，質(zhì)量穩(wěn)定可靠；
儀器適配性強(qiáng)：適用于市售各種全自動核酸提取儀進(jìn)行高通量提取；
安全無毒：使用環(huán)保型脫蠟液，較之二甲苯更安全、快速；
適合微量樣本DNA提取：可提取低至1片5μm的卷片。
產(chǎn)品性能
評估提取的DNA得率、純度、大片段占比
不同類型的FFPE樣本，包括小鼠心臟FFPE樣本、肝臟FFPE樣本、頸部軟組織FFPE樣本、甲狀腺FFPE樣本、肺部FFPE樣本，樣本的切片厚度為5μm，一次提取2卷；分別采用18375ES、競品1和競品2提取，每組3個重復(fù)；其中18375ES搭配翌圣AP-96自動化提取儀，提取的DNA用Qubit定量濃度，Nanodrop定量純度，Qsep100評估大片段的占比。如圖3-圖5所示，18375ES提取的DNA得率、純度、大片段占比都顯著優(yōu)于競品1和競品2。
圖3.不同F(xiàn)FPE樣本提取的 DNA得率
圖4.不同F(xiàn)FPE樣本提取的 DNA純度（260/280）
圖5.不同F(xiàn)FPE樣本提取的 DNA大片段占比
標(biāo)準(zhǔn)品（蠟卷）提取的DNA突變檢出率
采用標(biāo)準(zhǔn)品蠟卷（菁良）分別用18375ES、競品1和競品2提取DNA，DNA中含有5% EGFR T790M突變和5% EGFR L858R突變，各取200ng進(jìn)行酶切法DNA建庫（Cat#12195ES）和雜交捕獲，三種試劑盒提取的DNA雜交捕獲后的數(shù)據(jù)質(zhì)量和突變位點(diǎn)檢出率如圖6所示，18375ES和競品提取的DNA文庫數(shù)據(jù)質(zhì)量相當(dāng)，突變檢出率均在5%左右。
圖6.不同F(xiàn)FPE樣本提取的 DNA文庫數(shù)據(jù)質(zhì)量和突變位點(diǎn)檢出率
訂購信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 | 產(chǎn)品規(guī)格 |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit 磁珠法石蠟包埋組織DNA提取試劑盒（瓶裝）V2 | 18375ES50 | 50 T |
磁珠法核酸提取相關(guān)產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品應(yīng)用 | 產(chǎn)品編號 |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit | 磁珠法石蠟包埋組織DNA提取 | 18371ES |
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit | 血漿、血清游離DNA提取 | 18382ES |
MolPure® Magnetic Swab Viral DNA/RNA Kit | 拭子樣本病毒DNA/RNA提取 | 18300ES |
MolPure® Magnetic Tissue/Cell Total RNA Kit | 磁珠法組織/細(xì)胞總RNA提取 | 18600ES |
MolPure® Magnetic M4P1 Blood DNA Kit | 磁珠法血液DNA提取 | 18504ES |
MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit | 磁珠法土壤/糞便DNA提取 | 18526ES |
MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA | 磁珠法土壤/糞便DNA提取（預(yù)封裝） | 18528ES |
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