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RNA熒光原位雜交技術(shù)簡(jiǎn)介

來源:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司   2023年12月28日 10:48  

RNA表達(dá)水平高度動(dòng)態(tài),并集成了遺傳和表觀遺傳學(xué)的調(diào)控機(jī)制,可以作為分標(biāo)記物指示細(xì)胞的功能狀態(tài)。近年來,轉(zhuǎn)錄組分析在癌癥研究中的廣泛應(yīng)用業(yè)已證明,RNA與蛋白質(zhì)一樣可以作為臨床診斷、治療評(píng)估及預(yù)后預(yù)測(cè)的生物學(xué)指標(biāo)。為了充分利用RNA作為生物學(xué)標(biāo)記物的這些潛力, 迫切需要開發(fā)出有效的方法來常規(guī)檢測(cè)RNA 。
目前用RNA表達(dá)水平檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)較為常用的是:

1.RNA熒光原位雜交(RNA-FISH)技術(shù)用于在細(xì)胞中定位和定量特定的RNA分子。這項(xiàng)技術(shù)不僅有助于揭示基因表達(dá)的時(shí)空模式,還為研究者提供了關(guān)于細(xì)胞活動(dòng)和疾病機(jī)制的見解。RNA-FISH技術(shù)的歷史可以追溯到20世紀(jì)80年代,當(dāng)時(shí)科學(xué)家們開始嘗試在細(xì)胞中直接檢測(cè)RNA。然而,由于RNA的天然低豐度及易降解特性,這一技術(shù)的開發(fā)面臨巨大挑戰(zhàn)。直到20世紀(jì)90年代,隨著探針設(shè)計(jì)的改進(jìn)和新熒光染料的出現(xiàn),RNA-FISH才開始在科研中得到廣泛應(yīng)用。RNA-FISH技術(shù)的原理基于探針與靶序列的特異性結(jié)合。首先,研究人員會(huì)設(shè)計(jì)出與目標(biāo)RNA序列互補(bǔ)的熒光探針。這些探針在雜交緩沖液中與細(xì)胞中的目標(biāo)RNA結(jié)合,形成探針-靶RNA復(fù)合物。然后,通過洗滌步驟去除未結(jié)合的探針,最后用熒光顯微鏡觀察雜交信號(hào)的位置和數(shù)量。熒光原位雜交技術(shù)具有高度的特異性和敏感性,可以在細(xì)胞和組織水平上提供準(zhǔn)確的分子信息。它已成為生命科學(xué)研究和臨床診斷中的工具之一。熒光原位雜交市場(chǎng)在過去幾年中呈現(xiàn)穩(wěn)定增長(zhǎng),預(yù)計(jì)將繼續(xù)保持增長(zhǎng)趨勢(shì),該市場(chǎng)的價(jià)值預(yù)計(jì)將在未來幾年內(nèi)達(dá)到數(shù)億美元。目前ACD公司旗下的RNAscope®正是可滿足這一需求的新型的RNA原位雜交技術(shù),它可在組織和細(xì)胞中檢測(cè)目標(biāo)RNA,繪制真實(shí)而重要的信號(hào)通路和關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)。該技術(shù)基于其探針設(shè)計(jì)與背景抑制技術(shù),并且融合了傳統(tǒng)RNA原位雜交技術(shù)與FISH技術(shù)的優(yōu)點(diǎn),在單細(xì)胞水平,實(shí)現(xiàn)了單個(gè)RNA的可視化,代表了RNA原位雜交領(lǐng)域的一項(xiàng)重大進(jìn)步,是目前精準(zhǔn)的RNA檢測(cè)技術(shù)。目前,RNA熒光原位雜交技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用場(chǎng)景非常廣泛。例如,在基因功能研究方面,研究人員可以利用這項(xiàng)技術(shù)檢測(cè)特定基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)模式。在腫瘤診療領(lǐng)域,RNA-FISH可以用于檢測(cè)與癌癥相關(guān)的基因異常表達(dá),從而為疾病的診斷和治療提供參考。此外,RNA-FISH技術(shù)還可以用于研究病毒感染、神經(jīng)科學(xué)和藥理學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域。

2.空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)自斬獲了Nature Methods 2020 年“年度技術(shù)”以來,引起更加廣泛的關(guān)注。目前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)全球規(guī)模約4億美元,50%用戶在北美,未來十年年成長(zhǎng)率在25%以上。中國的用戶規(guī)模有望達(dá)到全球的20-30%,年成長(zhǎng)率在40%以上。然而,空間轉(zhuǎn)錄組的研究還需要擴(kuò)展檢測(cè)數(shù)量和分析工具,同樣地,空間背景下的分辨率、規(guī)模和信息種類也需要提高。


紅榮微再專注于分子診斷領(lǐng)域,早期技術(shù)團(tuán)隊(duì)包含多名國內(nèi)大學(xué)生物與遺傳學(xué)科博士,從多樣本核酸提取保存技術(shù)、自主研發(fā)緩沖體系、有抑制非特異性擴(kuò)增技術(shù)逐步完成了紅榮微再PCR實(shí)驗(yàn)方案,實(shí)現(xiàn)PCR擴(kuò)增效率以及檢測(cè)靈敏度的重大突破,也奠定了紅榮微再以技術(shù)為根本,客戶為導(dǎo)向的研發(fā)模式,建立以創(chuàng)新為驅(qū)動(dòng)的技術(shù)發(fā)展平臺(tái)。

2019年以來,經(jīng)歷社會(huì)、市場(chǎng)的多種變化革新,紅榮微再公司內(nèi)部也應(yīng)運(yùn)完成組織架構(gòu)更新與產(chǎn)業(yè)布局的調(diào)整。公司確立“RNA、NGS、ctDNA、qPCR”四大方向并齊發(fā)展模式,技術(shù)部門新設(shè)NIPT、伴隨診斷、腫瘤早篩、傳染病監(jiān)測(cè)、實(shí)驗(yàn)自動(dòng)化設(shè)備等相關(guān)團(tuán)隊(duì),組織海外留學(xué)博士、高新技術(shù)企業(yè)核心骨干完成新產(chǎn)品線的研發(fā)工作,面對(duì)快速增長(zhǎng)的市場(chǎng)下游需求,紅榮微再已初步完成多線產(chǎn)品的核心研發(fā)與標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn),主要包括核酸提取試劑盒、qPCR試劑盒、測(cè)序試劑盒以及分子診斷類產(chǎn)品的基礎(chǔ)儀器耗材等多個(gè)類別。


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