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抽提RNA實(shí)驗(yàn)色素污染去除方法

來源:上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司   2024年03月01日 11:05  

用Trizol法沉淀RNA容易有一些雜質(zhì)的。部分色素是會(huì)和RNA一起沉下來。這種情況可以用75%冷的乙醇多洗幾遍。對(duì)后續(xù)qRT-PCR多數(shù)情況下沒什么影響。

另外可以用硅膠柱法純化RNA,色素殘留會(huì)少一些。

RNase污染的來源

1:手指頭 – 手指頭是外源酶的第1來源,所以必需戴手套并且頻繁更換。另外,口罩也必需戴,因?yàn)楹粑彩且粋€(gè)重要的酶來源。戴手套口罩的另外的好處是保護(hù)實(shí)驗(yàn)人員。

2:槍頭,離心管,移液器 單純的滅菌是不能滅活RNase的,所以槍頭和離心管要用DEPC處理,即使是標(biāo)明為DEPC處理過的。移液器最/好是專用的,用前用75%的酒精棉球搽拭干凈,尤其是桿子;另外,一定不要使用褪頭器。

3:水/緩沖液 一定要確保無RNase污染。

4:實(shí)驗(yàn)臺(tái)面最起碼要用 75% 的酒精棉球搽拭干凈。

5:內(nèi)源 Rnase 所有組織均含內(nèi)源酶,故組織用液氮速凍是降低降解的最/好辦法。液氮保存/碾磨方法的確不方便,但對(duì)有一些內(nèi)源酶含量很高的組織,卻是唯1的辦法。

6:RNA 樣品 RNA抽提產(chǎn)物可能都會(huì)含痕量的RNase污染。

7:質(zhì)粒抽提 質(zhì)粒抽提往往用到RNase降解RNA,殘留的RNase要用 Proteinase K 消化,PCI 抽提。

8:RNA 保存 即使低溫保存,痕量的RNase亦會(huì)導(dǎo)致RNA降解。長/期保存RNA的最/好辦法是鹽/醇懸液,因?yàn)榇荚诘蜏貢r(shí)抑制所有的酶活性。

9:陽離子 (Ca, Mg) 在含這些離子時(shí),80℃加熱5分鐘會(huì)導(dǎo)致RNA被剪切,故如果RNA需要被加熱,保存液需要含螯合劑(1mM Sodium Citrate, pH 6.4)。

10:后續(xù)實(shí)驗(yàn)所用的酶 酶均有可能被Rnase污染。

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