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新品預(yù)告 | 突破技術(shù)壁壘,DNA甲基化MGI平臺文庫構(gòu)建試劑盒閃亮登場!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年07月09日 09:30  
 

背景介紹

 


隨著生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展,DNA甲基化(DNA methylation)標(biāo)志物在癌癥診斷、治療選擇及預(yù)后評估中的重要性日益凸顯。在現(xiàn)代腫瘤治療領(lǐng)域,腫瘤 DNA 甲基化標(biāo)志物作為一種重要的生物標(biāo)志物,在癌癥的早期診斷、治療選擇及預(yù)后評估中扮演著越來越關(guān)鍵的角色。

 

圖1.正常細胞與腫瘤細胞DNA甲基化的狀態(tài)

 

DNA 甲基化是一種 DNA 的共價修飾,具體是指DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)將甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5?甲基胞嘧啶的過程。成簇的 CpG被稱為 CpG島(CpG islands,CGIs),主要位于結(jié)構(gòu)基因的啟動子和第一外顯子區(qū)域。DNA 甲基化標(biāo)志物是癌細胞中的 DNA異常甲基化改變,這種異常甲基化貫穿于癌癥發(fā)生和發(fā)展的全過程。

 

腫瘤DNA甲基化標(biāo)志物檢測及臨床應(yīng)用專家共識(2024版)指出:與傳統(tǒng)的腫瘤標(biāo)志物相比,DNA甲基化標(biāo)志物具有更早期、更無創(chuàng)、更精準(zhǔn)等優(yōu)點。因此,可以通過非侵入性方式獲得的痰液、血漿、血清或尿液等樣本進行 DNA 甲基化標(biāo)志物檢測。一些DNA甲基化異常發(fā)生在腫瘤形成的初始階段,通過檢測與腫瘤發(fā)展相關(guān)的甲基化標(biāo)志物,可以輔助癌癥早期診斷、評估進展風(fēng)險。DNA 甲基化標(biāo)志物甲基化水平的增加或降低與腫瘤預(yù)后密切相關(guān),可用于治療或性手術(shù)后評估腫瘤微小殘留病灶(MRD)和監(jiān)測復(fù)發(fā)。此外,DNA甲基化標(biāo)志物還可作為化療敏感性的標(biāo)志,某些特定基因的甲基化可能預(yù)示著癌癥對治療的反應(yīng),可用于判斷化療藥物的療效,以更好地指導(dǎo)治療方案。

 

 

 

DNA甲基化標(biāo)志物檢測技術(shù)方法

 

圖2.DNA甲基化標(biāo)志物檢測技術(shù)方法

 

甲基化建庫試劑盒搭配MGI測序接頭一直以來為技術(shù)難點,MGI 測序接頭與 Illumina Y 字型接頭類型存在很大的差異,MGI 測序接頭 Linear adapter 與 Bubble adapter 長度不同但兩端互補配對,因此會產(chǎn)生小泡狀結(jié)構(gòu),小泡狀結(jié)構(gòu)會降低與單鏈DNA的連接效率,影響文庫產(chǎn)出和檢測的靈敏度。

 

翌圣生物甲基化研發(fā)團隊基于創(chuàng)新的MGI接頭設(shè)計方式和優(yōu)化接頭連接體系,開發(fā)出DNA甲基化MGI平臺文庫構(gòu)建試劑盒,性能媲美于Illumina平臺文庫構(gòu)建試劑盒,擁有優(yōu)異的接頭連接效率,較高的文庫產(chǎn)出,滿足微量cfDNA樣本的甲基化建庫需求。

 

 

 
 

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)

 
 

 

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產(chǎn)品簡介

 

Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是針對 MGI 測序平臺專業(yè)開發(fā)設(shè)計的新一代 DNA 甲基化建庫試劑盒,可以滿足甲基化轉(zhuǎn)化后10 pg~250 ng DNA 樣本建庫。該試劑盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 樣本,適應(yīng)于先轉(zhuǎn)化后建庫。

 

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產(chǎn)品亮點

 
  • 投入量低:可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫

  • 數(shù)據(jù)質(zhì)量佳:不同樣本類型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量

  • 操作簡便:2小時左右可以完成建庫

 

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產(chǎn)品性能

 
 
1、亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化后,采用12221和12226建庫,不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標(biāo)

MGI平臺甲基化建庫試劑12226和Illumina平臺甲基化建庫試劑12221的性能相當(dāng),MGI平臺甲基化建庫試劑12226的dup率更低。

 

圖3.不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標(biāo)

 

 

2、亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后,采用12226建庫,不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標(biāo)

相同的樣本投入量,酶法轉(zhuǎn)化搭配MGI平臺甲基化建庫試劑12226的文庫濃度和數(shù)據(jù)質(zhì)量更高,插入片段更長,文庫豐富度更高。

 

圖4.亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標(biāo)

 

 

 

新品預(yù)告

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

產(chǎn)品應(yīng)用

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI

 DNA 甲基化建庫MGI試劑盒  

12226ES

甲基化文庫構(gòu)建MGI平臺

敲重點:申請DNA 甲基化建庫MGI試劑盒試用裝,請聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N售或技術(shù),數(shù)量有限,試用回饋數(shù)據(jù)有獎。

 

 

 

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