引自10x Genomics的亞細胞空間原位表達分析技術（Xenium），通過已有/定制探針panel與靶點，在新鮮冷凍（FF）組織或福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織切片上快速檢測大量靶點的組織原位轉錄本表達水平，實現(xiàn)亞細胞分辨率對基因進行靶向空間原位分析，揭示細胞結構與功能的關系。

 一、技術流程及原理

首先在Xenium載玻片上制備FF或FFPE組織切片（每塊載玻片上的可成像區(qū)域為12mm x24mm）。然后對切片進行處理，RNA能更好的與可環(huán)化的DNA探針進行雜交。雜交探針連接后產(chǎn)生可酶促擴增的環(huán)狀DNA探針。之后將載玻片放入Xenium分析儀中，樣本在其中經(jīng)過連續(xù)幾輪的熒光探針雜交、成像和去除，產(chǎn)生明亮、易于成像且高信噪比的信號。接著生成每個基因特異性的熒光特征條碼，實現(xiàn)目標基因的定位和識別。最后構建出整張組織切片上亞細胞水平的空間原位圖譜。

 二、技術特點與優(yōu)勢

1、亞細胞分辨率

原位顯微成像的檢測方法，保留RNA分子的原位特征，亞細胞分辨率水平還原組織中細胞最真實的大小和邊界區(qū)分，實現(xiàn)“真”細胞-細胞通訊、受體-配體互作的可視化研究。

2、兼容多樣本類型

兼容新鮮冷凍組織（FF）和福爾馬林固定石蠟包埋組織（FFPE）樣品，滿足臨床及科研樣本的檢測分析需求。

3、高靈敏性和特異性

平均每個基因設計8對探針，根據(jù)表達量高低調(diào)整探針數(shù)量；du特的配對捕獲探針設計，增強了檢測的靈敏性和特異性。

4、panel組合靈活定制

panel基礎上，可靈活定制多至100個靶標基因，更兼容全定制服務，增強了臨床和科學研究的創(chuàng)新性，同時可根據(jù)普通轉錄組RNA-seq以及單細胞轉錄組數(shù)據(jù)scRNA-seq實驗中已獲取的數(shù)據(jù)，定制高達300個靶點的個性化研究策略，助力轉化研究和空間水平挖掘。

5、全景“無gap”掃描及玻片再利用

成像區(qū)域（12 x 24 mm）內(nèi)開展超高重靶點的組織全景無gap掃描，Xenium實驗后仍可繼續(xù)利用同一玻片做其他實驗，可高效充分地利用珍貴的臨床樣本。

6、強大的數(shù)據(jù)綜合分析及深度挖掘能力

wan全標準化的集成生物信息學分析流程，經(jīng)驗豐富的多組學數(shù)據(jù)分析團隊，能夠對生物學數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù)進行綜合分析及深度挖掘，使得數(shù)據(jù)挖掘更加便捷化、個性化。

 三、技術服務內(nèi)容

目前guan方已經(jīng)推出panel包括：人乳腺 280 個基因、人腦 266 個基因、人肺 289 個基因、人皮膚282個基因、人結腸322個基因、人腫瘤免疫380個基因、人類多種組織癌癥組織377個基因、小鼠腦 247 個基因和小鼠組織圖譜379個基因，以上panel均可增加 1~100 定制化基因。應用場景仍在不斷拓展，未來會有更多組織類型的商品化 Panel，應用于腫瘤、發(fā)育等不同領域的探索。