微生物種群鑒定測序（16S/18S/ITS）

簡介

自然界中的微生物多如恒河沙數(shù)，且其中絕大多數(shù)無法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過了十萬種，這還是一個正在急劇擴(kuò)大著的數(shù)字。DNA測序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準(zhǔn)確、快捷，不依賴菌種本身特點(diǎn)，對所有菌種均可使用。晶能憑借先進(jìn)的測序儀器和多年的微生物檢測經(jīng)驗(yàn)，為您可提供快速、高效、quan威的微生物檢測服務(wù)，包括細(xì)菌16SrDNA測序、真菌18SrDNA測序、ITS測序。

16SrDNA測序——作為一種應(yīng)用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標(biāo)基因測序技術(shù)，通過針對覆蓋16SrDNA的1個或多個連續(xù)可變性區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增測序來鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu)，Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺可以針對16SrDNA的1個區(qū)域進(jìn)行測序,具有對樣本更高的測序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費(fèi)用的優(yōu)勢完成科研項(xiàng)目。

18SrDNA測序——18SrDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA（18SrRNA）的DNA序列，其高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。通過分析18SrDNA序列，在較高級別上確定樣品的歸屬。
ITS（internaltranscribedspacer）測序——真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（internaltranscribedspacer,ITS），又叫內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)，是位于真菌核糖體DNA（rDNA）上18S和28S基因之間的區(qū)域片段，主要包括內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1（ITS1）、5.8SrDNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2（ITS2），其兩側(cè)分別是18SRNA基因和28SRNA基因

ITS序列由于選擇壓力小，在自然中變異較快，在絕大多數(shù)真菌中表現(xiàn)出序列多態(tài)性，表現(xiàn)為種內(nèi)相對一致，種間差異比較明顯，非常適合真菌鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育分析。由于ITS鑒定快速，分析準(zhǔn)確，有效彌補(bǔ)了傳統(tǒng)鑒定方法的不足，ITS的序列分析能實(shí)質(zhì)性地反映出屬間、種間以及菌株間的堿基對差異，易于分析，目前已被廣泛應(yīng)用于真菌屬內(nèi)不同種間或近似屬間的系統(tǒng)發(fā)育研究中。

流程圖

技術(shù)優(yōu)勢

1、擁有Miseq測序平臺，高質(zhì)量、高性價比的完成客戶項(xiàng)目；

2、多項(xiàng)相關(guān)項(xiàng)目的經(jīng)驗(yàn)，為客戶的項(xiàng)目提供保障。