應用簡介
核酸和蛋白質(zhì)是組成生命的主要生物大分子,兩者的相互作用是構(gòu)成生命活動的生長、繁殖、運動、遺傳和代謝等生命活動的基礎。研究蛋白質(zhì)和核酸間的相互作用是人們探索生命現(xiàn)象奧秘的關鍵,CHIP檢測實驗是應用于蛋白與核酸互作關系的重要參考。
技術原理
CHIP實驗在活細胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)-DNA復合物,并將其隨機切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學方法沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。
實驗方法

1、細胞樣本所需數(shù)量較大,需要提前按照所需細胞的要求整理,保證細胞所需量達到要求。
2、染色質(zhì)消化過程需要調(diào)整,以獲得更好的消化時間,需要進行相關梯度摸索。
3、不同細胞的處理時間和細胞數(shù)目會有差異,需要進行調(diào)整。
4、部分抗體級別可能達不到CHIP級別的要求,需要采購對應級別的抗體并通過陰陽性實驗反饋結(jié)果可信性。部分特異染色質(zhì)檢測靶序列可能無法在一次擴增中獲得較好的結(jié)果,需要不斷調(diào)整引物。
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