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微生物群落多樣主要包括物種多樣性、遺傳多樣性和功能多樣性3個方面，在環(huán)境、能源、食品與人體健康等諸多領域有著廣泛的研究與應用。16SrRNA擴增子測序技術是微生物群落多樣性檢測常用的組學技術之一，該技術無需對微生物分離培養(yǎng)，直接提取樣本里面所有微生物的基因組，利用合適的通用引物擴增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高變區(qū)或功能基因，采用高通量測序儀Miseq、Hiseq或Novaseq對其進行測序，通過生物信息學分析可以獲得特定實驗樣品中細菌、真菌或古菌等的物種組成、物種豐度、系統(tǒng)進化、群落比較等諸多信息。
16S rDNA測序
16S rDNA為編碼原核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列，具有10個保守區(qū)域和9個可變區(qū)域，其中保守區(qū)在細菌間差異不大（反映了生物物種間的親緣關系），可變區(qū)具有屬或種的特異性。對16S rDNA某個可變區(qū)進行測序，可用于研究微生物中細菌或古菌的群落結構多樣性。
原核微生物的16S rRNA基因長度約為1500 bp，二代測序平臺對應擴增引物一般選用V3-V4區(qū)域或V4區(qū)域，三代測序平臺可選用全長擴增引物（27F/1492R）。
圖1. 16S rDNA基因序列組成示意圖
（藍色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
18S rDNA測序
18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。對 18S rDNA某個高變區(qū)進行測序，用于研究環(huán)境樣本中真核微生物群落結構多樣性。
真核微生物18S rRNA基因長度1500-2000 bp，引物一般選用V4區(qū)域。
圖2. 18S rDNA基因序列組成示意圖
（藍色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
ITS測序
ITS分為兩個區(qū)域：ITS1和 ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和 5.8S之間，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之間。對ITS1（350 bp）或ITS2（400 bp）進行測序，用于研究環(huán)境微生物中真菌群落結構多樣性。
ITS區(qū)長度則為400-900 bp，引物一般選用ITS1區(qū)域。
（藍色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
宏條形碼測序
目標區(qū)域擴增子測序
產品介紹
16S rDNA文庫建庫試劑盒利用高通量測序技術對16S rDNA中V3-V4或V4區(qū)片段進行擴增，結合生物信息學技術，檢測特定環(huán)境下的微生物，鑒定所檢細菌種類，提供環(huán)境樣本物種分類、物種豐度、種群結構、系統(tǒng)進化等諸多信息。試劑盒中包含進行細菌16S rDNA擴增的所有試劑、16S PCR擴增引物F/R，組合Illumina 和MGI平臺 Index 引物試劑盒用于16S rDNA片段的擴增。
產品應用
科學研究：進行微生物群落結構和功能研究；
臨床監(jiān)測：用于疾病診斷、感染控制和治療監(jiān)測；
環(huán)境監(jiān)測：評估環(huán)境樣本中的微生物多樣性和污染情況；
農業(yè)研究：研究土壤微生物群落對作物生長的影響；
能源領域：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的開發(fā)；
食品相關監(jiān)測：檢測和控制食品中的微生物污染。
產品特點
適用多樣本類型：兼容大多數常見環(huán)境樣本，如土壤、糞便、水體、生物膜等；
高效率擴增：靈敏度低至0.1 ng，特異性優(yōu)，均一性好；
測序數據質量高：低背景、高覆蓋度、高均一性。
性能展示
產品信息
應用方向 | 產品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
提取試劑盒 | MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit 磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒 | 18526ES20 | 20 T |
18526ES50 | 50 T | ||
16S rDNA鑒定 |
16S（V3-V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit ForIllumina | 12983ES08 | 8 T |
12983ES24 | 24 T | ||
12983ES96 | 96 T | ||
16S（V4）Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI | 12933ES08 | 8 T | |
12933ES24 | 24 T | ||
12933ES96 | 96 T | ||
16S/18S/ITS/宏條形碼/功能基因擴增子等 | 2×Hieff NGS® HG MμLtiplex PCR Master Mix | 13283ES03 | 1 mL |
13283ES08 | 5×1mL | ||
16S 全長多重擴增試劑 | 2×Hieff® Ultra-Long PCR Master Mix | 10158ES03 | 1 mL |
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