很多小伙伴合成mRNA需要得到基因的CDS序列,今天我們一起來(lái)看下基因的CDS序列是怎么找到的。
1. 打開(kāi)NCBI網(wǎng)站
2. 點(diǎn)擊下列選項(xiàng),找到“Gene”
3. 選中“Gene”,在搜索框中輸入基因名稱,下圖以“Human TREM2”為例,點(diǎn)擊“Search”
4. 檢索頁(yè)面出現(xiàn)的第一個(gè)就是,如下圖:
5. 點(diǎn)擊進(jìn)去,進(jìn)入基因詳情頁(yè),可以看到有多個(gè)轉(zhuǎn)錄本,如下圖紅框圈出來(lái)的。
6. 點(diǎn)擊“reference sequence details”我們需要看下轉(zhuǎn)錄本的文獻(xiàn)引用和轉(zhuǎn)本的長(zhǎng)度進(jìn)行選擇那個(gè)使我們所需的轉(zhuǎn)錄本
7. 看到有2個(gè)
8. 點(diǎn)進(jìn)去看下CDS序列長(zhǎng)度,一般是選擇序列最長(zhǎng)的,如下圖選擇了“NM_018965.4”
9. 點(diǎn)“CDS”,就會(huì)彈出標(biāo)記棕色的序列,這就是此基因的CDS序列啦
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