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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)( PCR)技術(shù)循環(huán)檢測方法

來源:上海撫生實業(yè)有限公司   2025年07月15日 16:29  

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction, PCR)是一種用于擴(kuò)增特定DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。其核心原理是模擬生物體內(nèi)的DNA復(fù)制過程,通過特定的引物、DNA聚合酶和dNTPs(脫氧核糖核苷酸)來實現(xiàn)目標(biāo)DNA序列的指數(shù)級擴(kuò)增。

PCR技術(shù)的實現(xiàn)依賴于三個關(guān)鍵步驟的循環(huán)進(jìn)行:

一、變性(Denaturation):在高溫(通常90-96℃)下,雙鏈DNA模板中的氫鍵斷裂,導(dǎo)致雙鏈分開為兩條單鏈。這是擴(kuò)增過程中的第一步,也是將模板DNA變成單鏈狀態(tài)的過程。

二、退火(Annealing):溫度降低(通常50-65℃)后,引物與單鏈DNA模板上互補的序列結(jié)合。引物是短的DNA序列,設(shè)計用于與目標(biāo)DNA片段的兩端特定區(qū)域互補,從而引導(dǎo)后續(xù)的合成過程

三、延伸(Extension):在中溫(通常72℃左右)下,Taq DNA聚合酶(一種耐熱DNA聚合酶)作用于引物-模板復(fù)合物,沿著模板DNA合成新的互補鏈。這個過程中,dNTPs被聚合到引物的3'端,形成新的DNA鏈,直至達(dá)到模板的末端。

這三個步驟組成一個循環(huán),每完成一個循環(huán),目標(biāo)DNA片段的數(shù)量理論上增加一倍。通過25-35個循環(huán),可以將目標(biāo)DNA序列擴(kuò)增至數(shù)百萬倍,從而達(dá)到可以檢測的水平。

 

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PCR技術(shù)的檢測方法主要依賴于擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測,傳統(tǒng)的PCR通常通過瓊脂糖凝膠電泳來檢測產(chǎn)物。隨著技術(shù)的發(fā)展,出現(xiàn)了實時熒光定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(Digital PCR, dPCR)等更為先進(jìn)的檢測方法。

一、傳統(tǒng)PCR檢測:

瓊脂糖凝膠電泳:擴(kuò)增后的DNA片段通過電泳分離,根據(jù)其大小在凝膠上形成條帶,通過觀察條帶的出現(xiàn)與否來判斷擴(kuò)增是否成功。

二、實時熒光定量PCR(qPCR):

熒光染料法:使用SYBR Green I等染料,其能嵌入雙鏈DNA中并在熒光下發(fā)光,隨著PCR循環(huán)的進(jìn)行,熒光信號逐漸增強,通過檢測熒光強度來定量目標(biāo)DNA。

探針法:采用TaqMan探針等熒光標(biāo)記探針,探針與目標(biāo)序列結(jié)合后被DNA聚合酶酶切,報告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,釋放熒光信號,通過實時監(jiān)測熒光信號的變化來定量目標(biāo)DNA。

三、數(shù)字PCR(dPCR):

油包水液滴式數(shù)字PCR(ddPCR):將樣本分成數(shù)萬個獨立的微滴(液滴),每個微滴中包含少量的DNA模板。通過PCR擴(kuò)增后,檢測每個微滴中的熒光信號,陽性信號表示微滴中含有目標(biāo)DNA,陰性信號則表示沒有。通過泊松分布計算,最終獲得目標(biāo)DNA的絕對定量結(jié)果。

數(shù)字PCR技術(shù)由于其不依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線、操作簡單、靈敏度高(±10% copies/μL)和適合低豐度目標(biāo)檢測等優(yōu)勢,已成為一種非常有潛力的核酸定量技術(shù)。與傳統(tǒng)qPCR相比,它在低拷貝數(shù)目標(biāo)檢測、拷貝數(shù)變異分析、稀有突變檢測等領(lǐng)域展現(xiàn)出有的優(yōu)勢。

 

 


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