【應(yīng)用案例】Yaxin-1161G葉綠素?zé)晒鈨x助力轉(zhuǎn)錄組解析耐鹽堿植物的光合奧秘
2022年5月,河南科技學(xué)院園藝園林學(xué)院周建團(tuán)隊(duì)在Frontiers in Plant Science期刊發(fā)表研究論文《Integrated Analyses of Transcriptome and Chlorophyll Fluorescence Characteristics Reveal the Mechanism Underlying Saline–Alkali Stress Tolerance inKosteletzkya pentacarpos》。論文其余作者:齊安國(guó)、王保全、張曉靜、董啟迪、劉金秀。
隨著人口增長(zhǎng)與環(huán)境惡化,土壤鹽堿化已成為世界性問(wèn)題,大約7%的土地受到鹽堿化威脅。研究表明,種植耐鹽堿植物成為改善鹽堿地生態(tài)功能的重要發(fā)展方向。Kosteletzkya pentacarpos L.(海濱錦葵)為多年生鹽生植物,具油料、飼料、醫(yī)藥和美化等價(jià)值,1993年由美國(guó)引入到江蘇,2011年被引入華北黃河灘頭,進(jìn)行鹽堿地資源開(kāi)發(fā),表現(xiàn)較強(qiáng)的抗逆性?;邴}堿脅迫下海濱錦葵2+3代轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、葉綠素?zé)晒馓匦缘龋ㄟ^(guò)加權(quán)基因共表達(dá)分析與正交偏最小二乘回歸分析,從差異表達(dá)基因中篩選出KvAGO4、KvLARP1C、KvPUB33等關(guān)鍵基因,功能涉及siRNA介導(dǎo)DNA甲基化、抑制TOP mRNAs翻譯、泛素/蛋白酶體降解等負(fù)調(diào)控因子,以及細(xì)胞程序性死亡等途徑。本研究為探究海濱錦葵耐受鹽堿脅迫的分子機(jī)理,及后期植物分子育種、高效耐鹽堿種質(zhì)資源培育奠定了基礎(chǔ)。
在該研究中,Yaxin-1161G葉綠素?zé)晒鈨x成為關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)設(shè)備,幫助實(shí)驗(yàn)人員深入探究了海濱錦葵的耐鹽堿機(jī)制。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)該儀器精準(zhǔn)測(cè)量了植物的葉綠素?zé)晒鈪?shù)(如初始熒光F?、最大光化學(xué)效率Fv/Fm、光化學(xué)猝滅系數(shù)qP等),揭示了植物在鹽堿脅迫下光合系統(tǒng)的穩(wěn)定性,為后續(xù)基因調(diào)控分析提供了重要數(shù)據(jù)支撐。
研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),高濃度鹽堿處理7天后,F?顯著升高,但Fv/Fm(光合系統(tǒng)II最大效率)保持穩(wěn)定,表明植物光合核心功能未受?chē)?yán)重?fù)p傷。光化學(xué)猝滅系數(shù)(qP)和PSII量子產(chǎn)量(ΦPSII)在長(zhǎng)期脅迫下下降,提示鹽堿壓力影響光能轉(zhuǎn)化效率。數(shù)據(jù)表明,光合系統(tǒng)的穩(wěn)定性是海濱錦葵耐鹽堿的重要特征。
基于Yaxin-1161G獲取的熒光參數(shù),結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),團(tuán)隊(duì)篩選出9個(gè)與鹽堿脅迫響應(yīng)相關(guān)的關(guān)鍵基因(如KpAGO4、KpLARP1C、KpPUB33等)。這些基因主要參與siRNA介導(dǎo)的DNA甲基化、泛素-蛋白酶體降解、細(xì)胞程序性死亡等負(fù)調(diào)控通路,揭示海濱錦葵通過(guò)抑制細(xì)胞生長(zhǎng)相關(guān)基因翻譯、調(diào)控蛋白降解及細(xì)胞死亡程序,維持光合系統(tǒng)穩(wěn)定性的分子機(jī)制。
值得關(guān)注的是,Yaxin-1161G的精準(zhǔn)表型數(shù)據(jù)為正交偏最小二乘回歸分析(OPLS-RA)提供了核心變量,通過(guò)關(guān)聯(lián)熒光參數(shù)與基因表達(dá)量,最終鎖定關(guān)鍵基因?qū)夂闲阅艿恼{(diào)控作用,實(shí)現(xiàn)了從生理表型到分子機(jī)制的跨層次解析。
該研究不僅揭示了海濱錦葵耐鹽堿的“光合穩(wěn)定策略”,更通過(guò) Yaxin-1161G等儀器的應(yīng)用,為耐鹽堿植物篩選提供了“生理表型檢測(cè) + 基因功能驗(yàn)證”的高效技術(shù)路徑。解析了海濱錦葵的耐鹽堿機(jī)制,為鹽堿地生態(tài)修復(fù)提供了分子育種新靶點(diǎn)。在未來(lái),相關(guān)基因的分子設(shè)計(jì)或可培育出更高耐鹽堿的作物,助力邊際土地農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)。
關(guān)于 Yaxin-1161G葉綠素?zé)晒鈨x
作為植物逆境生理研究的“黃金標(biāo)準(zhǔn)”工具,Yaxin-1161G具備以下優(yōu)勢(shì):
? 多參數(shù)同步檢測(cè):一次測(cè)量獲取F?、Fv/F?、qP、ΦPSII等核心熒光參數(shù),全面評(píng)估光系統(tǒng)功能。
? 精準(zhǔn)可控光源:配備5000 μmol?m?2?s?1飽和脈沖光與2000 μmol?m?2?s?1作用光,滿足不同脅迫條件下的測(cè)量需求。
? 便攜高效:適合溫室、田間等多場(chǎng)景應(yīng)用,為長(zhǎng)期脅迫實(shí)驗(yàn)提供穩(wěn)定數(shù)據(jù)支持。
無(wú)論是光合機(jī)制解析、抗逆品種篩選,還是生態(tài)修復(fù)研究,Yaxin-1161G始終是您可靠的科研伙伴。
【注】文中數(shù)據(jù)來(lái)源:Zhou J, Qi A, Wang B, Zhang X, Dong Q and Liu J (2022) Integrated Analyses of Transcriptome and Chlorophyll Fluorescence Characteristics Reveal the Mechanism Underlying Saline–Alkali Stress Tolerance in Kosteletzkya pentacarpos. Front. Plant Sci. 13:865572. doi: 10.3389/fpls.2022.865572.
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