英文名稱：CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
中文名稱：CY3-5TAMRA-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸-酪氨酸-絲氨酸-脯氨酸-蘇氨酸-絲氨酸-脯氨酸-絲氨酸

分子結(jié)構(gòu)與設(shè)計特點

CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS是一種經(jīng)過熒光標(biāo)記修飾的多肽探針，具有特定的氨基酸序列與雙重?zé)晒鈽?biāo)記。其核心肽段“YSPTSPS”重復(fù)三次，是來源于真核RNA聚合酶II CTD（C端結(jié)構(gòu)域，C-terminal domain）的典型七肽重復(fù)序列之一。該序列在多種生物調(diào)控過程中具有一定的結(jié)構(gòu)或功能指示意義，常被用于研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白相互作用、磷酸化等生物過程。

在肽鏈兩端分別連接了兩種不同的熒光染料：CY3和5-TAMRA。其中，CY3是一種常用的綠色熒光染料，具有良好的水溶性和光穩(wěn)定性，常用于熒光顯微成像和FRET實驗；5-TAMRA（5-羧基四甲基羅丹明）則發(fā)出橙紅色熒光，具有較高的熒光量子產(chǎn)率。這種雙重標(biāo)記的設(shè)計為多通道熒光檢測和動態(tài)跟蹤提供了便利，能夠?qū)崿F(xiàn)對多肽在細(xì)胞內(nèi)外行為的實時監(jiān)測。

應(yīng)用背景與功能探討

CTD序列中的“YSPTSPS”在真核生物中廣泛存在，且易受絲氨酸殘基位點磷酸化調(diào)控。此類序列的重復(fù)形式常作為表征CTD修飾狀態(tài)的模型肽段。在CY3-5TAMRA-YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS中，這種重復(fù)為研究其序列在蛋白相互作用、酶促修飾等過程中的功能提供了模型基礎(chǔ)。

該探針在細(xì)胞生物學(xué)研究中可被用于熒光共定位、相互作用檢測、分子軌跡追蹤、以及FRET（熒光共振能量轉(zhuǎn)移）等實驗。通過利用兩個熒光染料間的空間接近性，可探討肽段構(gòu)象變化或分子間的物理接觸。

標(biāo)記方式與結(jié)構(gòu)優(yōu)勢

CY3和5-TAMRA分別標(biāo)記在肽鏈的N末端與C末端，這種頭尾標(biāo)記方式有助于研究肽鏈構(gòu)象變化對染料之間距離的影響。同時，由于肽鏈本身為中性且富含親水性氨基酸，使得探針整體具有較好的水溶性，便于在水相或細(xì)胞環(huán)境中使用。

5-TAMRA為ROX類熒光染料，其激發(fā)和發(fā)射波長分別約為546 nm和579 nm，與CY3的激發(fā)（約550 nm）和發(fā)射（約570 nm）具有部分重疊，使得它們在FRET或多重成像系統(tǒng)中可以進(jìn)行合理區(qū)分與聯(lián)用。

純度與質(zhì)量控制

該多肽通常采用固相合成法（SPPS）進(jìn)行制備，并經(jīng)過HPLC純化與質(zhì)譜檢測確認(rèn)其分子量和標(biāo)記位點的完整性。純度一般在95%以上，確保用于熒光成像或生化實驗時具備良好的信噪比與重復(fù)性。

儲存與使用建議

為保持其光學(xué)穩(wěn)定性，建議將該多肽避光冷凍保存（-20℃以下），并避免多次反復(fù)凍融。溶解時推薦使用DMSO或含少量有機(jī)溶劑的緩沖體系，并根據(jù)具體實驗條件選擇適宜的濃度和體系。

產(chǎn)地：西安瑞禧生物

用途：科研

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