過濾時，使用前必須根據被濾介質的理化性質選用合適的微孔濾膜。作為微孔濾膜的材料有很多種，其性能又有所不同。常用微孔過濾膜有如下幾種：

（1）    水系微孔濾膜：一般用于純水相的過濾。在過濾含有機相的混合溶劑時應盡量避免使用水系濾膜，以防濾膜被溶解，因為水系濾膜一般由纖維素類的材料制成。纖維素類膜材料的特點是親水性好、成孔性好、來源廣泛，但耐酸堿和有機溶劑能力差，抗蠕變性能差。水系濾膜系列包括：醋酸纖維素膜、硝酸纖維素膜、混酯膜再生纖維素膜、聚醚砜等。

（2）    有機系微孔濾膜：用于有機溶劑的過濾。常用有機系微孔膜：聚四氟乙烯膜（PTFE）、聚偏二氟乙烯膜（PVDF）、聚偏氟乙烯

（3）    混合濾膜過濾：一般用于水系、有機系通用?；旌蠟V膜過濾：尼龍膜、改性的聚偏氟乙烯（改良親水性）、聚四氟乙烯膜（改良親水性）、聚偏二氟乙烯膜（改良親水性）。脂肪族尼龍，有良好的親水性，耐適當濃度的酸堿，不僅適用于含有酸堿性的水溶液，亦適用于含有有機溶劑，例醇類、烴類、醚類、酯類、酮類，苯和苯的同系物，二甲基甲酰胺，二甲基亞砜等等，是適用范圍zui廣的微濾膜之一。