可以采用染色法。碘化丙啶是紅色熒光活力染料，結(jié)合DNA。碘化丙啶不能穿透活細(xì)胞和早期凋亡細(xì)胞的細(xì)胞膜，當(dāng)細(xì)胞失去膜的完整性，碘化丙啶可染色DNA，也就是說(shuō)它可以染死細(xì)胞，這個(gè)是常用的方法。
    Trypan Blue是一種常被使用于細(xì)胞染色的染劑。Trypan Blue無(wú)法穿透活細(xì)胞的細(xì)胞膜，但是當(dāng)細(xì)胞受傷或死亡，細(xì)胞膜破損時(shí)，Trypan Blue則可以通透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)，使細(xì)胞染成藍(lán)黑色。利用此一特點(diǎn)，配合血球計(jì)數(shù)器的使用，則可以在奧林巴斯顯微鏡（CX22/CX31/CX41)底下，分辨出細(xì)胞樣本中的活細(xì)胞與死細(xì)胞，以方便細(xì)胞計(jì)數(shù)。
    一般用美藍(lán)與堿性品紅的復(fù)合染料進(jìn)行死菌的區(qū)分。染色后，活菌染為藍(lán)色，死菌和培養(yǎng)基偏紅，在顯微鏡（CX22/CX31/CX41)下很好區(qū)分。堿性品紅用乙醇加熱溶解，過(guò)濾，按1：10左右加入，可以根據(jù)情況適當(dāng)調(diào)整到可以區(qū)分活菌和培養(yǎng)基即可。這是發(fā)酵中檢查是否染菌的zui常用方法。
    蘸取含細(xì)菌的液體LB培養(yǎng)基，在奧林巴斯顯微鏡下直接觀察，活菌游動(dòng)，而死菌不動(dòng)，這是zui簡(jiǎn)單的一種粗略的方法，用戶可以試試。