科學家在單細胞水平上研究表觀遺傳調控的動力學變化
近日,發(fā)表于雜志Science上的一項研究論文中,來自加州理工學院等多個機構的研究人員通過研究設計出了一種新方法,其可以將組成染色體的物質縮減成為一種基因調節(jié)的完整模型,研究者認為這種新方法可以幫助理解基因組表達及調節(jié)的通路。
研究者Keung表示,對染色質組織的研究近年來發(fā)展非常迅速,這對于我們理解多種疾病的發(fā)病過程提供了新的思路,但很多研究都只停留在了細胞水平上來進行。本文研究中我們提出了一種新的算法,去可以幫助更為深入地研究染色質的結構組裝,這種方法基于觀察單一染色體調節(jié)子如何操作來產生不同的基因表達,從而就可以幫助創(chuàng)立一種新型的模型。
研究者指出,這種模型是基于框架的發(fā)展從而在數(shù)量上描述單一染色質調節(jié)子(CRs)的行為,同時還考慮到了這些染色質調節(jié)子如何調控基因的表達,以及這些改變的持久性和其關聯(lián)性。研究人員可以利用這種框架模型,通過時間間隔顯微鏡(time-lapse microscopy)技術對單一細胞進行縱向測量來比較四種不同的染色質調節(jié)子的不同。zui終的結果就是產生一種三狀態(tài)的模型來幫助捕捉非遺傳影響基因表達的動力學變化情況。
由于研究者建立的模型比較簡單,因此其比較適合于研究高水平下的生化問題,研究者Keung就指出,將這種模型同此前研究所獲得的數(shù)據(jù)進行連接或許可以提供更加深入細致的數(shù)據(jù)信息,同時建立這種新型模型也非常重要,因為其可以提供一種邏輯們改變來解釋染色質生物學研究中的復雜性及多種問題。
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