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甲基化分析的常見(jiàn)問(wèn)題解答

來(lái)源:上海復(fù)申生物科技有限公司   2016年04月06日 13:38  

常見(jiàn)問(wèn)題解答:

Q:在用Zymo的重亞硫酸鹽試劑盒處理前,起始DNA樣本應(yīng)該儲(chǔ)存在TE,水,還是其他緩沖液中?

A:水和TE緩沖液均可用來(lái)儲(chǔ)存DNA,并且不會(huì)對(duì)轉(zhuǎn)化過(guò)程造成干擾。

 

Q: 為什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit,我的DNA沒(méi)有得到*的轉(zhuǎn)化?

A 1 如果是固體樣本,很可能是處理的樣本量過(guò)大,而導(dǎo)致不*DNA轉(zhuǎn)化;

  2)如果是FFPE組織樣本,有可能是DNA已大規(guī)模受損以及/或者交聯(lián),導(dǎo)致不*轉(zhuǎn)化;

  3)如果在Proteinase K消化后,沒(méi)有通過(guò)離心去除碎片,則可能會(huì)干擾重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化過(guò)程,導(dǎo)致DNA的不*轉(zhuǎn)化;

 

Q:  為什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化(96孔板)產(chǎn)品線有兩種不同的目錄號(hào)?

A:   這兩種不同的目錄號(hào)是用來(lái)區(qū)分試劑盒內(nèi)不同類型的96孔板。深孔板和淺孔板均適用于大多數(shù)離心機(jī)和微板架。如下闡釋了這兩類96孔板的區(qū)別:

 

 

Silicon-A

Zymo-Spin I-96

款式

淺孔

深孔

尺寸(H x W x L

19 mm x 83 mm x 125 mm

35 mm x 83 mm x 125 mm

結(jié)合/收集板組合高度

43 mm

60 mm

結(jié)合力/zui小洗脫體積

5µg/30µl per well

5µg/15µl per well

貨號(hào)

D5003, D5007, D5022, D5032

D5004,D5008, D5023, D5033

 

Q Zymo 重亞硫酸鹽處理試劑盒與illumina技術(shù)平臺(tái)兼容嗎?

A:  是的,ZymoEZ DNA Methylation Kit技術(shù)被illumina推薦使用在其GoldenGateInfinium Assays平臺(tái)上;

 

Q ZymoEZ DNA Methylation Kit轉(zhuǎn)化得到的DNA可用作哪些下游分析應(yīng)用?

A:  Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit轉(zhuǎn)化得到的DNA,可適用于后續(xù)的各類測(cè)序分析法,Ms-SNuPE, COBRA,  Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如: SequenomEpiTYPER), 以及其他分析方法。

 

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