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RNA-seq數(shù)據(jù)分析方法2011/06/08: 高通量RNA測(cè)序（RNA-seq）有望描繪出轉(zhuǎn)錄組的整體圖像，實(shí)現(xiàn)樣本內(nèi)所有基因及其亞型的完整注釋和定量。隨著測(cè)序價(jià)格的不斷下降，以及個(gè)人化測(cè)序儀的上市，更多的實(shí)驗(yàn)室有機(jī)會(huì)嘗試這種新技術(shù)。然而，測(cè)序之后的數(shù)據(jù)分析才是真正的挑戰(zhàn)。在RNA-seq之后，還需要一些強(qiáng)大的計(jì)算工具，才能繪制出完整的轉(zhuǎn)錄組圖譜。在這一期的《自然—方法學(xué)》（NatureMethods）上，來自MIT和哈佛B(yǎng)road研究院的研究人員發(fā)表了一篇綜述，介紹了轉(zhuǎn)錄組注釋和定量的計(jì)算方法。首先，他們介紹了一些方法，將讀數(shù)與參考轉(zhuǎn)錄組

新概念心血管疾患診斷程序2011/06/08: KAIST（總長：徐楠杓）5月27日發(fā)表了生命化學(xué)工學(xué)系的樸鉉圭教授利用大腸菌開發(fā)了誘發(fā)心血管疾患的血液內(nèi)Homocysteine濃度的分析技術(shù)。研究組通過遺傳子的再組合，制作了相互不同的兩個(gè)生物發(fā)光大腸菌的營養(yǎng)要求主，對(duì)Homocysteine的兩菌主成長差異以生物發(fā)光信號(hào)進(jìn)行了分析。根據(jù)KAIST資料，此技術(shù)可以對(duì)大量的血液樣品同時(shí)進(jìn)行分析，非常經(jīng)濟(jì)。所以在zui近急速生長的Homocysteine定量檢查領(lǐng)域的商業(yè)化中，得到了非常大進(jìn)步的專家評(píng)價(jià)。原有的利用孝素反應(yīng)或高性能液體色譜圖表的方

我國快速建立腸出血性大腸桿菌檢測(cè)法2011/06/07: 近日，我國細(xì)菌學(xué)科學(xué)家、生物技術(shù)科學(xué)家聯(lián)手，快速建立腸出血性大腸桿菌O104H4檢測(cè)方法和鑒定方法，并已開始向全國推廣。中國CDC（疾病預(yù)防控制中心）傳染病預(yù)防控制所所長徐建國研究員日前在接受本報(bào)記者專訪時(shí)稱，該方法的建立，為我國各地及時(shí)捕捉可能入侵的這一新發(fā)病原提供了有力武器。徐建國介紹，已知常見腸出血性大腸桿菌（EHEC）血清型有3個(gè)：O157、O26、O111；不常見的血清型有40多種。zui近在德國引起暴發(fā)疫情的O104H4是EHEC家族中的一種罕見的血清型，含有志賀毒素2（vtx2a）

與人腦發(fā)育有關(guān)的*基因“現(xiàn)身”2011/06/07: 據(jù)英國《每日電訊報(bào)》日前報(bào)道，科學(xué)家找到了與人腦發(fā)育有關(guān)的*基因——層粘連蛋白γ3（LAMC3），這種基因會(huì)決定人大腦皮質(zhì)的特征。新研究有望讓科學(xué)家理解大腦內(nèi)的褶皺如何形成；也有助于科學(xué)家早日研制出“人造大腦”。美國耶魯大學(xué)和土耳其幾家科研機(jī)構(gòu)的科學(xué)家攜手對(duì)一名大腦缺乏明顯褶皺的土耳其病人進(jìn)行研究后做出了上述發(fā)現(xiàn)。耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的教授穆拉特·居內(nèi)爾在《自然·遺傳學(xué)》雜志上表示，揭示出這種基因在人腦發(fā)育過程中的基本作用能讓我們更好地理解大腦皮質(zhì)。大腦皮質(zhì)是大腦內(nèi)的褶皺，其掌控了人類的感情、本能與短

頭發(fā)可促傷口愈合2011/06/07: 對(duì)日益講究時(shí)髦的都市人而言，頭發(fā)zui大的功能不外是整體形象的一部分。但如果本地研究能在未來取得突破，頭發(fā)可能在醫(yī)療領(lǐng)域中扮演重要角色，協(xié)助人體加快傷口愈合的速度。由南洋理工大學(xué)材料科學(xué)與工程學(xué)院助理教授黃奇?zhèn)ィ?7歲）領(lǐng)導(dǎo)的四人小組過去一年多來積極展開了這方面的探索工作。黃奇?zhèn)ソ邮鼙緢?bào)訪問時(shí)解釋，纖維原細(xì)胞（fibroblast）是促進(jìn)傷口愈合的關(guān)鍵細(xì)胞之一，而角蛋白（keratin）有助于這類細(xì)胞的增生。人類的頭發(fā)60%至90%的構(gòu)成部分為角蛋白，因此若能有效地把頭發(fā)提取出來的角蛋白融入傷口

延安推廣玉米品種引轉(zhuǎn)基因爭(zhēng)議2011/06/07: 一年前，媒體報(bào)道的“先玉335”玉米在山西導(dǎo)致田鼠減少、母豬絕育等生態(tài)問題，引發(fā)對(duì)“先玉335”是否轉(zhuǎn)基因的身份之爭(zhēng)。日前，延安市農(nóng)科所在當(dāng)?shù)孛襟w向農(nóng)民推薦“先玉335”，再次引發(fā)爭(zhēng)議。一些反對(duì)轉(zhuǎn)基因食品的志愿者發(fā)帖質(zhì)疑：今年3月，農(nóng)業(yè)部發(fā)布推介的玉米品種，已將“先玉335”排除在外，而地方農(nóng)科所為何仍在向農(nóng)民朋友鄭重推薦“先玉335”？記者調(diào)查發(fā)現(xiàn)，盡管不斷有各級(jí)農(nóng)業(yè)機(jī)構(gòu)先后為“先玉335”正名——“先玉335”不是轉(zhuǎn)基因玉米，但圍繞其爭(zhēng)議一直不休。爭(zhēng)議的背后，則是一些人士對(duì)種子安全乃至食品安

G蛋白偶聯(lián)受體特異性的抑制劑2011/05/06: G蛋白偶聯(lián)受體盡管功能非常多樣，但結(jié)構(gòu)卻非常保守，含有一個(gè)七跨膜的核心結(jié)構(gòu)域和三個(gè)細(xì)胞膜內(nèi)結(jié)構(gòu)域和三個(gè)細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域。骨質(zhì)疏松治療的新方法在NatureMedicine上的報(bào)道發(fā)現(xiàn)將palmitate基團(tuán)連在GPCR蛋白酶激活受體1（PAR1？？protease-activatedreceptor1）和PAR4的肽端上能夠強(qiáng)力拮抗受體的正常功能。這些細(xì)胞通透性的脂質(zhì)化肽端，命名為pepducins，因此能夠被用來減弱GPCR的正常功能，以及對(duì)相關(guān)的信號(hào)傳導(dǎo)通路進(jìn)行抑制。許多疾病與GPCR有非常重要

人類原代細(xì)胞癌變轉(zhuǎn)化的新途徑2011/05/06: 人類的原代細(xì)胞對(duì)于致癌變的轉(zhuǎn)化作用是比小鼠細(xì)胞有抵抗能力的，人類原代細(xì)胞需要在三個(gè)特別的遺傳位點(diǎn)（theHRAS-V12oncogene,theSV40earlyregionandthecatalyticsubunitofomerase（TERT））進(jìn)行重組才可能發(fā)生轉(zhuǎn)化，而小鼠細(xì)胞有兩個(gè)原癌基因發(fā)生重組就可以了。對(duì)這一現(xiàn)象的解釋還很不清楚，可能是小鼠細(xì)胞更容易永生化，例如它們具有更長的端粒和自己表達(dá)端粒酶。這可能是原因之一，因?yàn)樵谌祟愒?xì)胞中需要的第三個(gè)不同位點(diǎn)就是對(duì)端粒的維持和永生比較重要

追蹤癌癥標(biāo)記物——新型抗體掃描法2011/05/06: 研究人員利用一種新型抗體掃描法發(fā)現(xiàn)了一種可能的前列腺癌腫瘤標(biāo)記物。由于癌癥患者通常會(huì)產(chǎn)生抗特定腫瘤抗原的特異性抗體——這對(duì)診斷來說非常重要，因此在2003年1月份的《自然—生物技術(shù)》雜志上，得克薩斯大學(xué)M.D.Anderson癌癥中心的科學(xué)家報(bào)告了一種通過掃描癌癥患者血清中相應(yīng)抗體而識(shí)別腫瘤特異性抗原的方法。他們的方案包括4個(gè)主要步驟：*步，除去所有血清樣本中的普遍存在的抗體；第二步，反復(fù)提純癌癥患者血清中的癌癥特異性抗體；第三步，識(shí)別能與這些癌癥特異性抗體結(jié)合的合成抗原；zui后一步，識(shí)別首先

以人類細(xì)胞來做為心跳節(jié)律器2011/05/06: 科學(xué)家從老鼠的初步研究中發(fā)現(xiàn)人類自己的細(xì)胞也許能夠代替人工的心跳節(jié)律器，科學(xué)家測(cè)試了未成熟的骨骼肌細(xì)胞的能力，讓其連接心臟細(xì)胞并且將維持正常心跳的電子脈沖傳送出去。研究主持人Cowan表示：“也許在未來的某一天我們就能夠使用人類體內(nèi)的細(xì)胞技術(shù)脫離心跳節(jié)律器的束縛了。”當(dāng)心房開始發(fā)出電子訊號(hào)時(shí)，心臟就會(huì)收縮，接著訊號(hào)就會(huì)傳送到其他的房室。若是心房與心室的電子訊號(hào)傳送遭受破壞，則心臟會(huì)*阻塞，不但可能危及生命，而且*的治療房室為植入心跳節(jié)律器。目前每22000名新生兒當(dāng)中就有一名罹患心臟傳導(dǎo)阻斷，此

對(duì)肺癌有效的新生物制劑2011/05/06: 由于吸煙人口的普遍及年輕化導(dǎo)致肺癌的發(fā)生率及死亡率都排名在癌癥的*，因此肺癌的治療變成是目前zui熱門的話題，遺憾的是目前雖然有很多新抗癌藥物如太平洋紫杉醇Gemcitabin、Navelbin等，每人要花達(dá)數(shù)十萬元，但對(duì)末期病患只有延長二個(gè)多月，因此新藥的研發(fā)成為研究室及藥廠zui大的發(fā)展目標(biāo)之一。Iressa（ZD1839）目前是zui被看好對(duì)肺癌有效的新生物制劑，主要作用是抑制上皮生長激素接受體之酥氨基酸溶解？，此物質(zhì)常見于各種癌細(xì)胞之過度表現(xiàn)，尤其是肺癌。zui近的臨床實(shí)驗(yàn)以Iressa

蛋白質(zhì)與細(xì)胞作用過程全記錄2011/05/06: 想要觀察記錄蛋白質(zhì)與細(xì)胞在其自然環(huán)境中真實(shí)的作用情形一直是分子與細(xì)胞生物學(xué)家的夢(mèng)想。這個(gè)夢(mèng)想將可在洛克斐勒大學(xué)的新研究成果中實(shí)現(xiàn)了。洛克斐勒大學(xué)利用1980年代所研發(fā)出的電腦科技----量子點(diǎn)，讓這些能發(fā)熒光的納米晶體能安全地活體組織中作用，讓科學(xué)家得以借由熒光顯微鏡的幫助，每分每秒地追蹤蛋白質(zhì)與細(xì)胞真實(shí)的作用情形。SanfordSimon博士表示，如果確實(shí)了解一個(gè)蛋白質(zhì)與細(xì)胞在其自然環(huán)境下的功用，就必須要能實(shí)況觀察到他們?cè)谠摥h(huán)境下的作用與移動(dòng)情形，例如像是囊胞性纖維癥或是阿茲海默癥等疾病都是因

發(fā)明蛋白酶無線遙控法2011/05/06: 美國麻省理工學(xué)院科學(xué)家發(fā)明了一種用無線電波控制細(xì)胞內(nèi)部活動(dòng)的方法。參與此項(xiàng)研究的焦瑟弗?加卡博松說，這個(gè)發(fā)現(xiàn)雖距建造“微生物機(jī)器”的路途還很遙遠(yuǎn)，不過已看到希望。由焦瑟弗?加卡博松等人完成的實(shí)驗(yàn)表明，一些能夠被無線電電波遙控的蛋白酶———單細(xì)胞微生物可像計(jì)算機(jī)那樣被裝載一定的程序、定期完成指令性工作。加卡博松所在的研究小組在電磁場(chǎng)的幫助下學(xué)會(huì)了開啟和關(guān)閉蛋白酶。據(jù)悉，為了做到這一點(diǎn)，科學(xué)家向蛋白酶中放入了大小約為百萬分之一毫米的金粉末，在磁場(chǎng)作用下，金粉末猶如無線電接收器一樣使蛋白酶從電磁場(chǎng)中獲

血小板凝血機(jī)理有新發(fā)現(xiàn)2011/05/06: 這是一個(gè)經(jīng)特殊處理的小白鼠破損血管凝血的真實(shí)活動(dòng)畫面，畫面十分清晰：血液在不斷地流動(dòng)，在破損的血管處，血小板在不斷堆積，直至流血被止住。通過對(duì)血小板凝血現(xiàn)象的活體觀察，安徽醫(yī)科大學(xué)特聘教授、旅加學(xué)者倪合宇發(fā)現(xiàn)了血小板凝集中一些此前世界上無人知曉的新現(xiàn)象，他的這些成果近日被載入美國新版教科書《血小板》上。半個(gè)世紀(jì)以來，醫(yī)學(xué)界都認(rèn)為纖維蛋白元和VWF因子是血小板凝血時(shí)必須具備的兩種物質(zhì)。倪合宇通過對(duì)活體動(dòng)物模型的觀察發(fā)現(xiàn)，正常小鼠在血管破損后，6分鐘創(chuàng)口處即有穩(wěn)定的血液栓子形成，9～10分鐘，血管*

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