化學蛋白組學的實驗流程與數據分析檢測技術服務詳情介紹

化學蛋白組學（Chemical Proteomics）是一種結合化學探針和高分辨質譜分析的方法，能夠在原位、原態(tài)條件下系統(tǒng)地解析dànbáizhì的功能狀態(tài)、相互作用和小分子靶標。這一策略在藥物發(fā)現、酶功能研究、翻譯后修飾識別等領域具有廣泛應用價值。本文將系統(tǒng)梳理化學蛋白組學的實驗流程與數據分析思路，幫助科研人員深入理解這一前沿技術，并探討如何借助zhuānyè平臺如百泰派克生物科技，高效推進相關研究。

一、什么是化學蛋白組學？

化學蛋白組學是基于可共價修飾dànbáizhì的化學探針（chemical probes），通過活性位點標記、親和富集與質譜鑒定，實現對dànbáizhì功能狀態(tài)的全景描繪。

其核心優(yōu)勢在于：

1、特異性強：可設計特異性探針靶向某一類酶或結構基序（如sīānsuān水解酶、半guāngānsuān殘基等）；

2、原位應用：能在細胞甚至動物水平上直接進行；

3、功能導向：不僅識別蛋白，還關注其活性狀態(tài)或小分子結合位點。

二、化學蛋白組學實驗流程解析

整個實驗流程通常包括以下關鍵步驟：

1、化學探針設計與合成

探針通常包括三部分：

（1）識別基團：與目標蛋白活性位點結合；

（2）可反應基團：與蛋白形成共價鍵；

（3）標簽結構：用于后續(xù)富集或熒光/光親和標記，如biotin、alkyne等。

常見探針類型：

（1）ABPP（Activity-Based Protein Profiling）探針

（2）Photoaffinity labeling 探針

（3）Covalent ligand 探針

2、樣本處理與探針標記

* 將探針添加至細胞裂解液或活細胞中，充分孵育；

• 對照組加入非活性類似物或過量競爭小分子，用于鑒別特異性結合。

3、點擊化學修飾（Click Chemistry）

利用CuAAC反應將探針標記的alkyne結構與biotin-azide等進行共價連接，便于后續(xù)的富集步驟。

4、蛋白富集與酶切

* 通過鏈霉親和素磁珠進行富集；

• 富集后的蛋白進行yídànbáiméi酶切，獲得可上機的肽段。

5、質譜檢測（LC-MS/MS）

采用高分辨Orbitrap或Q-TOF質譜平臺對肽段進行jīngquè檢測，獲取肽段序列、修飾位點及相對豐度信息。

在百泰派克生物科技，我們使用優(yōu)化的富集-酶切流程與Thermo Orbitrap Exploris等優(yōu)良質譜平臺，確保化學蛋白組學實驗在靈敏度和重復性方面表現優(yōu)異。

三、數據分析策略

化學蛋白組學數據分析與常規(guī)dànbáizhì組學有所不同，需結合化學修飾位點和定量特征，常用流程包括：

1、數據預處理

• 使用MaxQuant、Proteome Discoverer等軟件進行MS數據識別和定量；

• 識別化學探針標記位點（如alkyne標簽位點）；

• 去除背景綁定（通過競爭組、空白組過濾）。

2、特異性結合蛋白篩選

• 設定豐度比值（如DMSO對比探針標記組）閾值；

• 結合統(tǒng)計學分析（如t-test, FDR校正）篩選高置信靶標。

3、功能注釋與通路富集

• 利用DAVID、Metascape、STRING等工具，分析標記蛋白的分子功能、亞細胞定位、信號通路；

• 揭示特定探針或小分子作用的生物學機制。

4、靶標驗證（可選）

進一步通過Western Blot、Co-IP或功能實驗證實核心靶蛋白的功能角色與結合關系。

四、應用案例：從機制研究到藥物開發(fā)

化學蛋白組學已經在多個方向展現出強大的應用潛力：

1、新型藥物靶點發(fā)現：識別小分子共價結合的dànbáizhì靶標（如KRAS G12C、BTK）；

2、酶活性譜分析：通過ABPP探針評估細胞內酶活性動態(tài)變化；

3、翻譯后修飾研究：檢測氧化、硝化、烷基化等修飾位點；

4、細胞應答機制探索：分析藥物或應激因子誘導的蛋白活性變化。

五、百泰派克生物科技：一站式化學蛋白組學解決方案

在百泰派克生物科技，我們提供從探針篩選建議、實驗方案定制、富集與上機、到數據分析與生物學解釋的全流程服務，助力您的科研項目快速推進：

• 經驗豐富的化學修飾蛋白組專家團隊

• 高通量自動化樣本處理平臺

• Orbitrap高分辨質譜jīngzhǔn鑒定

• 深度分析報告 + 生物學注釋支持

化學蛋白組學作為連接“結構-功能-靶點”研究的橋梁，正日益成為功能dànbáizhì組學的重要組成部分。它不僅揭示了dànbáizhì如何被調控，更為藥物靶標識別和機制闡明提供了dútè視角。如果您正關注某一小分子的蛋白靶標、某類酶的活性變化，或希望以功能為導向深入解析蛋白組學——歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，開啟您的專屬化學蛋白組學研究方案。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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