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用Edman降解解決抗體開發(fā)中的N末端阻斷挑戰(zhàn)檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在抗體藥物的研發(fā)過程中,dànbáizhì序列的準(zhǔn)確解析是確保藥物功能與安全性的核心環(huán)節(jié)。然而,抗體分子N末端的化學(xué)修飾或結(jié)構(gòu)異常(即“N末端阻斷”)常導(dǎo)致傳統(tǒng)測序技術(shù)失效,這一問題已成為抗體開發(fā)領(lǐng)域長期存在的技術(shù)瓶頸。Edman降解作為一種經(jīng)典的Nduāncèxù方法,憑借其dútè的化學(xué)特性,在應(yīng)對這一挑戰(zhàn)中展現(xiàn)出bùkětìdài的價(jià)值。本文將深入探討N末端阻斷的成因及其對抗體開發(fā)的影響,并解析Edman降解技術(shù)如何突破這一困境。


一、抗體開發(fā)中的N末端阻斷難題

1、N末端阻斷的生物學(xué)基礎(chǔ)

抗體分子的N末端區(qū)域是抗原結(jié)合位點(diǎn)(CDR區(qū))的重要組成部分,其結(jié)構(gòu)完整性直接決定抗體的特異性與親和力。然而,在重組表達(dá)或儲存過程中,N末端可能發(fā)生多種不可預(yù)測的化學(xué)修飾:例如jiǎliúānsuān殘基的氧化、氨基甲酰化反應(yīng),或是宿主細(xì)胞酶系導(dǎo)致的非預(yù)期剪切。這些修飾不僅改變dànbáizhì的理化性質(zhì),更會掩蓋N末端的游離氨基,導(dǎo)致基于氨基反應(yīng)的測序技術(shù)無法啟動。


2、技術(shù)挑戰(zhàn)的雙重性

N末端阻斷帶來的影響具有雙重性:一方面,阻斷位點(diǎn)阻礙了常規(guī)質(zhì)譜分析中對肽段N端的識別,導(dǎo)致序列覆蓋率出現(xiàn)關(guān)鍵缺口;另一方面,在抗體工程化改造中,若無法確認(rèn)N端修飾類型,將難以設(shè)計(jì)有效的突變體進(jìn)行功能優(yōu)化。更棘手的是,某些修飾(如環(huán)化反應(yīng))可能形成穩(wěn)定的共價(jià)結(jié)構(gòu),常規(guī)的還原烷基化處理難以有效逆轉(zhuǎn)。


二、Edman降解的技術(shù)原理與dútè優(yōu)勢

Edman降解是一種經(jīng)典而可靠的dànbáizhìN端順序測定技術(shù)。由Pehr Edman在20世紀(jì)40年代提出,它基于化學(xué)方法對多肽鏈N端的氨基酸逐一識別,過程溫和、選擇性強(qiáng),是zuì早實(shí)現(xiàn)自動化蛋白測序的技術(shù)。其基本原理是:利用苯異硫氰酸酯(PITC)與N端氨基發(fā)生專一反應(yīng),在堿性環(huán)境下形成PITC衍生物,繼而通過酸水解切斷dìyī個(gè)氨基酸,并將其轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定的?;惲虬彼幔≒TH)形式,再經(jīng)高效液相色譜(HPLC)分析確認(rèn)氨基酸種類。此過程循環(huán)進(jìn)行,每輪脫去一個(gè)氨基酸,逐步獲得完整N端序列。


Edman降解在應(yīng)對N端阻斷時(shí)具備以下幾個(gè)突出的優(yōu)勢:


  • 高度特異的N端識別機(jī)制,可判斷N端是否真實(shí)暴露;

  • 對小范圍修飾具備一定容忍度,可通過預(yù)處理手段“解封”部分封閉結(jié)構(gòu);

  • 無需復(fù)雜的數(shù)據(jù)庫或假設(shè)序列支持,避免質(zhì)譜中“猜測式”匹配誤差;

  • 適用于高純度抗體的驗(yàn)證分析,尤其是在質(zhì)譜信號不理想的區(qū)域補(bǔ)充信息。


三、在抗體開發(fā)流程中的應(yīng)用場景

在現(xiàn)代抗體藥物開發(fā)流程中,從序列設(shè)計(jì)、表達(dá)構(gòu)建,到功能篩選和生產(chǎn)放大,序列信息始終處于核心地位。Edman降解在以下關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)中展現(xiàn)出dútè價(jià)值:

1、抗體序列確認(rèn)階段

在構(gòu)建表達(dá)載體或篩選抗體片段庫時(shí),研究人員需確保所選序列與目標(biāo)序列一致。尤其在單克隆抗體篩選中,部分抗體可能在表達(dá)后其N端被修飾或丟失。利用Edman降解可快速確認(rèn)N端起始氨基酸,防止因錯(cuò)配引起的親和力變化或結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。


2、工藝開發(fā)中的質(zhì)量控制

抗體在大規(guī)模表達(dá)中可能由于宿主細(xì)胞酶活、培養(yǎng)條件或純化步驟引發(fā)N端結(jié)構(gòu)變化。若依賴質(zhì)譜分析無法確認(rèn)N端位點(diǎn),極易遺漏批次差異。Edman降解可作為關(guān)鍵點(diǎn)位的驗(yàn)證手段,強(qiáng)化質(zhì)量監(jiān)控體系。


3、法規(guī)審評與申報(bào)支持

藥品監(jiān)管機(jī)構(gòu)對生物藥要求jígāo的一致性證明。若N端區(qū)域存在不確定性,將影響整個(gè)序列完整性聲明。Edman降解可以在法規(guī)申報(bào)材料中作為結(jié)構(gòu)確認(rèn)的補(bǔ)強(qiáng)證據(jù),提高產(chǎn)品研發(fā)透明度與可信度。


4、抗體改造與新構(gòu)型評估

在抗體人源化、Fc工程或構(gòu)建融合抗體(如scFv、BiTE)時(shí),N端多被改造。Edman降解可協(xié)助研發(fā)人員jīngquè掌握融合區(qū)的表達(dá)情況,避免功能域遮蔽或空間構(gòu)象異常。


Edman降解,雖然歷經(jīng)多年技術(shù)發(fā)展與替代浪潮,仍在解決具體科研與應(yīng)用難題中展現(xiàn)出dúyǒu價(jià)值。尤其是在N末端阻斷這樣的“隱性障礙”前,它提供了jīngzhǔn、高效、可靠的解決路徑?;貧w實(shí)驗(yàn)本源、擁抱技術(shù)多樣性,正是當(dāng)前dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)突破的必要路徑。而Edman降解,正是這一路徑中被低估卻bùkěhuòquē的一環(huán)。百泰派克生物科技提供zhuānyè的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務(wù),可解決您的項(xiàng)目問題,加速您的研究項(xiàng)目,為您帶來優(yōu)質(zhì)的服務(wù)體驗(yàn)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

用Edman降解解決抗體開發(fā)中的N末端阻




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



用Edman降解解決抗體開發(fā)中的N末端阻斷挑戰(zhàn)檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹


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