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HiSep 2500 HiSep 2500 測序系統(tǒng)

具體成交價以合同協(xié)議為準
  • 公司名稱 埃克森(北京)科技有限公司
  • 品牌 illumina/美國因美納
  • 型號 HiSep 2500
  • 產(chǎn)地
  • 廠商性質(zhì) 代理商
  • 更新時間 2016/2/18 12:29:04
  • 訪問次數(shù) 661

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??松ū本┛萍加邢薰臼且患覍W⒂谏镏委熍c干細胞研究的高科技企業(yè),坐落于中關(guān)村生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)園。公司自成立以來一直秉承"專業(yè)、誠信、高效"的經(jīng)營理念,致力于向用戶提供*的產(chǎn)品、*化的解決方案和高品質(zhì)的專業(yè)服務(wù),在同行業(yè)中保持良好的企業(yè)形象和競爭優(yōu)勢。 公司與國內(nèi)外諸多干細胞研究實驗室,大型的生物治療公司,臍血庫,*醫(yī)院保持著密切的合作關(guān)系,向國內(nèi)用戶提供*成熟的設(shè)備與應(yīng)用技術(shù),構(gòu)筑“一站式”科學服務(wù)平臺,以此推動生命科學發(fā)展與創(chuàng)新。公司擁有專業(yè)、可靠、高效的隊伍,多年的行業(yè)經(jīng)驗和*的經(jīng)營理念,努力在產(chǎn)品的售前、售中和售后都提供專業(yè)的技術(shù)服務(wù)和完整解決方案,確保我們的用戶和合作伙伴無后顧之憂!專注于生物治療,專注于干細胞研究,與*技術(shù)同步,以生命科技創(chuàng)造健康,造福人類,服務(wù)未來。

設(shè)備儀器,凍存袋

產(chǎn)品介紹:

HiSep 2500新一代測序儀

*的靈活性

HiSeq 2500系統(tǒng)是Illumina*臺*兩種運行模式的測序系統(tǒng),包括快速運行和高產(chǎn)量運行模式,可使用一個或兩個流動槽,使之成為一個靈活且可擴展的平臺??焖龠\行模式提供快速的結(jié)果、數(shù)量有限樣品的高效處理,以及更長的末端配對150 bp讀取,這帶來了更深度的覆蓋,并改善de novo應(yīng)用的組裝。高產(chǎn)量模式特別適合樣品量較多的大型研究,或需要zui深度覆蓋的應(yīng)用。高產(chǎn)量模式可處理的樣品量是快速模式的~5倍,讓大型項目可通過盡可能少的運行來完成。

HiSeq 2500的多個配置讓產(chǎn)量可調(diào),既能在7小時內(nèi)獲得~10 Gb或~3億個單端讀取,又能在11天內(nèi)獲得600 Gb或60億個末端配對讀取,這取決于應(yīng)用需求或項目期限。高效的樣品批處理從未如此簡單,而周轉(zhuǎn)時間也從未如此之快。HiSeq 1500也具有這兩種運行模式,支持單個流動槽,而不是兩個。HiSeq 1500/2500系統(tǒng)讓您的實驗室擁有*的靈活性,以便支持zui廣泛的應(yīng)用和研究規(guī)模。

驚人的速度和通量

快速運行模式是HiSeq系統(tǒng)設(shè)計上的一個革命性附加,它通過縮短的循環(huán)時間和內(nèi)置的簇生成來顯著加快運行。在快速運行模式下,您能夠完成全自動的簇生成和測序,在一個工作日內(nèi)實現(xiàn)短讀取應(yīng)用,或在一天多的時間內(nèi)通過末端配對100 bp讀取實現(xiàn)全基因組測序應(yīng)用。數(shù)據(jù)通量超過100 Gb,因此一天內(nèi)人類基因組的測序覆蓋度超過30倍(圖1)。在需要快速且準確的答案時,快速運行時間再加上的數(shù)據(jù)質(zhì)量很關(guān)鍵??焖龠\行模式的加速運行以及平行處理約6億個測序模板的能力帶來了現(xiàn)有測序系統(tǒng)中zui高的每日通量。

 

圖1:*的靈活性支持多個應(yīng)用

 

有了兩種運行模式以及使用一個或兩個流動槽的能力,HiSeq 2500支持廣泛的應(yīng)用和研究規(guī)模。本圖中的數(shù)據(jù)是例子,基于使用兩個流動槽的系統(tǒng)性能。因簇密度、樣品質(zhì)量,及其他實驗因素不同,可能會出現(xiàn)差異。運行時間是近似的,快速運行模式包括簇生成和測序,而高產(chǎn)量模式只包括測序。添加索引的運行時間未包括在內(nèi)。

出色的數(shù)據(jù)質(zhì)量

 

高的數(shù)據(jù)質(zhì)量是通過行業(yè)中zui廣泛采用的邊合成邊測序(SBS)技術(shù)的應(yīng)用來確保的。HiSeq 1500/2500系統(tǒng)的SBS技術(shù)利用的可逆終止子方法對數(shù)百萬個片段進行測序,在單個堿基摻入增長的DNA鏈時檢測它們。由于每個測序循環(huán)中四種與可逆終止子結(jié)合的dNTP都存在,故自然競爭讓摻入偏向zui小化,與其他技術(shù)相比大大降低了原始錯誤率。zui終結(jié)果是高度準確的base-by-base測序,幾乎避免了序列背景特異的錯誤,即使是在那些重復序列區(qū)和同聚物中。Illumina測序帶來了行業(yè)中任何覆蓋水平的zui準確人類基因組、zui高產(chǎn)量的無錯誤讀取以及zui高比例的>Q30堿基檢出(圖2)。

圖2:快速運行模式下的讀取 vs. Q值

快速運行模式下HiSeq 2500系統(tǒng)上人類基因組2 x 101 bp運行的質(zhì)量值。這個例子表明,92%的堿基高于Q30。

的數(shù)據(jù)質(zhì)量和存儲方案

Illumina生物信息學的新發(fā)展包括數(shù)據(jù)壓縮改善、測序比對算法更快,以及一套即插即用的數(shù)據(jù)計算和存儲方案。

HiSeq 1500/2500軟件將數(shù)據(jù)體積縮小50%以上,而不會損害數(shù)據(jù)質(zhì)量。這允許產(chǎn)量加倍,而無需將數(shù)據(jù)存儲能力擴大兩倍。HiSeq 1500/2500軟件還能夠與BaseSpace® 實時連接,這是一種云計算環(huán)境,可實現(xiàn)實時的堿基檢出、比對后的數(shù)據(jù)分析以及可擴展的數(shù)據(jù)存儲。將數(shù)據(jù)上傳至BaseSpace可實時進行,通常在運行完成幾分鐘后結(jié)束。BaseSpace中的數(shù)據(jù)上傳、數(shù)據(jù)比對或變異檢出不會產(chǎn)生任何額外的費用。研究人員可通過BaseSpace云端開展合作,與世界上的任何人即時安全地共享數(shù)據(jù)。

BaseSpace還提供Illumina序列分析和比較軟件(iSAAC™)- 目前zui快的比對軟件。iSAAC軟件的速度有了4-6倍的提高,可在幾小時內(nèi)將一個30x的基因組與參考基因組比對。比對可在BaseSpace中免費開展,或利用經(jīng)濟的商業(yè)化計算硬件開展。iSAAC軟件對生物學家而言簡單易用,而對生物信息學家而言又足夠靈活,可訪問并修改開放源代碼。BaseSpace應(yīng)用商店將提供更多的工具和軟件,帶來商業(yè)化、免費軟件和用戶開發(fā)應(yīng)用的組合。

研究人員也可使用IlluminaCompute™,這是一套即插即用的測序數(shù)據(jù)計算和存儲方案。IlluminaCompute*來自我們的合作伙伴Dell和EMC Isilon的行業(yè)技術(shù),來自Illumina客戶解決方案的安裝和維護,以及一套預置的軟件,用于數(shù)據(jù)處理、比對和變異檢測。有了IlluminaCompute,實驗室可在幾周而不是幾個月內(nèi)全面投入運作,甚至無需預先購買IT設(shè)備。

 



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