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R300718 Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

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重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司是中國中西部地區(qū)*家專業(yè)從事生物技術(shù)產(chǎn)品銷售(包括:生物試劑、生物耗材、儀器設(shè)備、技術(shù)產(chǎn)品等)、干細(xì)胞儲存、干細(xì)胞相關(guān)基礎(chǔ)研究、干細(xì)胞臨床應(yīng)用研究及技術(shù)服務(wù)的新技術(shù)企業(yè)。供應(yīng)造血干細(xì)胞培養(yǎng)基,神經(jīng)干細(xì)胞培養(yǎng)基,干細(xì)胞無血清培養(yǎng)基,胚胎/IPS干細(xì)胞無血清培養(yǎng)基,心肌細(xì)胞分化培養(yǎng)基,外周血核型分析培養(yǎng)基。公司立足西南,面向全國,以“積極借鑒成功經(jīng)驗(yàn),追求創(chuàng)新”為核心思想,將為客戶提供水平的干細(xì)胞產(chǎn)品和服務(wù)。

“華雅干細(xì)胞”是由我們公司的全體員工用心打造的一塊金質(zhì)招牌,我們的團(tuán)隊:富有激情、相互信任、目標(biāo)*、熱愛干細(xì)胞事業(yè)、用心為我們的干細(xì)胞客戶服務(wù)。干細(xì)胞產(chǎn)業(yè)的蓬勃發(fā)展需要產(chǎn)業(yè)鏈中的每個成員精耕細(xì)作,協(xié)同發(fā)展,實(shí)踐創(chuàng)新。

華雅干細(xì)胞公司立志為中國干細(xì)胞產(chǎn)業(yè)的進(jìn)步與發(fā)展做出應(yīng)有的貢獻(xiàn),為人類健康事業(yè)更上一層樓而不懈努力!


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Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

產(chǎn)品名稱: PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3    產(chǎn)品貨號:R300718 

 
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
· 單細(xì)胞(或<15 pg DNA)起始,可獲得可重復(fù)的結(jié)果
· 等位基因再現(xiàn)性
· 易于使用和自動化
· 應(yīng)用廣泛,可以用于微陣列,PCR等
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以從單細(xì)胞擴(kuò)增DNA,獲得高度可重復(fù)的文庫。細(xì)胞裂解和預(yù)擴(kuò)增后,進(jìn)行低背景的PCR擴(kuò)增,并在3小時內(nèi)獲得微克級產(chǎn)物。
除了延續(xù)之前PicoPLEX WGA Kit可進(jìn)行高度可重復(fù)的拷貝數(shù)變異(CNV)分析外,該試劑盒通過使用高保真酶,盡可能減少擴(kuò)增誤差,并能檢測單核苷酸變異(SNV)。
 

 

 
 
 
圖1. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV檢測
 
以來自不同細(xì)胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的單細(xì)胞起始,使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3擴(kuò)增基因組。之后取1ng的擴(kuò)增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在Illumina MiSeq(PE 75)進(jìn)行測序。對Fastq文件去除接頭序列信息后,與human genome assembly GRCh37進(jìn)行比對。只分析常染色體。對于這兩個panels,校準(zhǔn)歸一化至100萬reads,使用bedtools 2.25.0計算每1 Mb的 bin的reads數(shù)。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)繪制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3還顯示了可以高品質(zhì)的進(jìn)行染色體異倍性分析。
 
圖2. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因組覆蓋范圍的重現(xiàn)性高
 
以GM12878的單細(xì)胞樣本起始(一式兩份),分別使用PicoPLEX WGA v3,A公司試劑盒和B公司試劑盒擴(kuò)增基因組。之后取1ng的擴(kuò)增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在MiSeq(PE 75)進(jìn)行測序。然后與human genome assembly GRCh37進(jìn)行比對,歸一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后,使用bedtools 2.25.0計算每個1 Mb的bin的reads數(shù)。對這兩個單細(xì)胞文庫的每個窗口的total read進(jìn)行繪制,計算Pearson和Spearman相關(guān)性并在每個圖中標(biāo)明。
Panel A. 包含異常值的樣本。*由于不同技術(shù)存在不同的偏差,沒有排除相關(guān)點(diǎn),所以圖表的比例不同。
Panel B. 排除異常值的樣本。與A公司和B公司試劑盒相比,PicoPLEX WGA v3具有更高的重現(xiàn)性和覆蓋度。

Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

 

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