R400492 ThruPLEX 文庫構建試劑盒 現(xiàn)貨
- 公司名稱 重慶市華雅干細胞技術有限公司
- 品牌 TaKaRa
- 型號 R400492
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 代理商
- 更新時間 2025/2/18 8:07:48
- 訪問次數(shù) 2011
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 應用領域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
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ThruPLEX 文庫構建試劑盒 現(xiàn)貨
產(chǎn)品名稱:ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit 產(chǎn)品貨號:R400492
高品質(zhì)血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑 |
ThruPLEX® Plasma-seq Kit |
· 專為cfDNA設計:經(jīng)過優(yōu)化的修復及連接試劑 · 高品質(zhì)NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內(nèi),可以達到高檢測再現(xiàn)性 · 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量 · 快速簡便:無需純化或樣品轉(zhuǎn)移的單管、2小時、3步操作步驟 · 應用領域:液態(tài)活檢、ctDNA、目標區(qū)域測序等領域文庫構建 · 兼容自動化平臺:Beckman® FXP Workstation |
■ 產(chǎn)品說明: |
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫構建。 該試劑專門針對cfDNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區(qū)域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。 血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。 |
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圖1. ThruPLEX® 技術概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技術3步反應即可完成針對cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進行末端修復。通過采用莖環(huán)形接頭(無單鏈尾巴)進行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進一步降低背景。高保真度擴增的方式完成以上反應,并獲得含有illumina index的文庫。 |
(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.) |
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圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,且每個文庫產(chǎn)生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后,計算Duplication rates。 |
(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.) |
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圖3. 優(yōu)異的靶向測序文庫構建能力。圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫通過panel進行高效捕獲,對kinome進行深度測序分析以檢測突變。3個血漿樣品分別起始建庫量為5 ng、6.5 ng、10 ng,三次重復。目標區(qū)域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進行捕獲,并用Illumina Miseq平臺進行測序,平均每個文庫獲得5 M reads,目標堿基被成功捕獲分析。 |
(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.) |
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