從頭測(cè)序的優(yōu)勢(shì)與應(yīng)用領(lǐng)域檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在dànbáizhì組學(xué)研究中，大多數(shù)質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析依賴于數(shù)據(jù)庫(kù)搜索法（Database Search），即通過(guò)已知dànbáizhì序列對(duì)實(shí)驗(yàn)質(zhì)譜圖譜進(jìn)行匹配。從頭測(cè)序（De novo Sequencing）作為wánquán不依賴參考數(shù)據(jù)庫(kù)的序列解析方法，成為了解鎖未知dànbáizhì結(jié)構(gòu)與功能的重要工具。

一、從頭測(cè)序的核心優(yōu)勢(shì)

1、wánquán獨(dú)立于數(shù)據(jù)庫(kù)

從頭測(cè)序基于質(zhì)譜儀采集的串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）數(shù)據(jù)，直接解析肽段的氨基酸序列，無(wú)需借助數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)照。對(duì)于非模式生物、環(huán)境樣本、古生物材料等缺乏注釋信息的樣本，具有天然優(yōu)勢(shì)。

2、可發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)中未收錄的新肽段

在腫瘤、感染或基因突變等生物學(xué)背景下，dànbáizhì表達(dá)譜可能與標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)顯著不同。從頭測(cè)序可識(shí)別出新生肽段、剪接變異產(chǎn)物、融合蛋白等結(jié)構(gòu)信息，為機(jī)制研究和靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供基礎(chǔ)。

3、對(duì)突變和修飾具有高度敏感性

從頭測(cè)序能夠識(shí)別非同義突變、氨基酸替換和微小插入缺失，同時(shí)支持對(duì)多種翻譯后修飾（PTMs）的解析，如磷酸化、乙?；?、糖基化等。

4、啟用多種算法提升準(zhǔn)確率

現(xiàn)代從頭測(cè)序流程通常融合多種計(jì)算算法，如譜圖匹配（Tag-based）與圖論算法（Graph-based），結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)輔助判讀，使得在復(fù)雜背景下的序列還原更加jīngzhǔn與高效。

二、從頭測(cè)序的主要應(yīng)用領(lǐng)域

從頭測(cè)序廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究、臨床轉(zhuǎn)化、工業(yè)生物技術(shù)等多個(gè)領(lǐng)域。

1、基礎(chǔ)生命科學(xué)研究

• 用于功能未知dànbáizhì的結(jié)構(gòu)解析

• 支持系統(tǒng)進(jìn)化研究中非模式物種間的序列對(duì)比

• 輔助信號(hào)通路重建與功能注釋，尤其在物種特異性dànbáizhì上具有dútè價(jià)值

2、疾病機(jī)制研究與jīngzhǔn醫(yī)學(xué)

• 揭示突變相關(guān)的新生肽段，為個(gè)性化診療提供生物標(biāo)志物基礎(chǔ)

• 識(shí)別疾病相關(guān)dànbáizhì的修飾狀態(tài)變化，如腫瘤細(xì)胞中tèyǒu的磷酸化圖譜

• 幫助發(fā)現(xiàn)潛在新抗原，支持個(gè)體化miǎnyìzhìliáo策略開(kāi)發(fā)

3、抗體開(kāi)發(fā)與結(jié)構(gòu)確認(rèn)

• 應(yīng)用于雜交瘤或自然來(lái)源抗體序列解析，支持結(jié)構(gòu)優(yōu)化與zhuānlì規(guī)避

• 在抗體人源化與親和力成熟中，提供jīngquè序列模板

• 可用于雙特異抗體、多特異抗體的結(jié)構(gòu)域識(shí)別與驗(yàn)證

4、生物技術(shù)與工業(yè)蛋白分析

• 適用于合成多肽、重組蛋白等產(chǎn)品的序列驗(yàn)證

• 評(píng)估生產(chǎn)過(guò)程中的微小變異或突變風(fēng)險(xiǎn)，增強(qiáng)質(zhì)量控制能力

• 在仿制藥一致性評(píng)價(jià)中應(yīng)用廣泛，尤其在蛋白結(jié)構(gòu)比較環(huán)節(jié)中價(jià)值顯著

5、微生態(tài)與環(huán)境樣本研究

• 分析微生物群落表達(dá)的未知dànbáizhì，挖掘潛在酶資源與代謝通路

• 監(jiān)測(cè)環(huán)境樣本中的生物標(biāo)志物蛋白或外源污染物響應(yīng)蛋白

• 輔助解析jíduān環(huán)境生物適應(yīng)機(jī)制

三、從頭測(cè)序的潛在挑戰(zhàn)

盡管從頭測(cè)序在多個(gè)領(lǐng)域表現(xiàn)出強(qiáng)大能力，但仍面臨一些技術(shù)性挑戰(zhàn)：

1、譜圖質(zhì)量要求高

從頭測(cè)序嚴(yán)重依賴高分辨率、高信噪比的MS/MS譜圖。質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量直接決定解析的準(zhǔn)確性與覆蓋度，尤其對(duì)低豐度肽段較為敏感。

2、修飾與異構(gòu)體判讀困難

部分修飾位點(diǎn)（如異構(gòu)磷酸化、糖基化）具有相同質(zhì)量信息，解析難度大。且多修飾共存情況下，肽段碎裂譜圖更為復(fù)雜，提升算法性能成為未來(lái)關(guān)鍵方向。

3、缺乏標(biāo)準(zhǔn)驗(yàn)證手段

由于不依賴參考數(shù)據(jù)庫(kù)，從頭測(cè)序結(jié)果難以直接比對(duì)驗(yàn)證，依賴轉(zhuǎn)錄組對(duì)照、同位素標(biāo)記或人工合成驗(yàn)證等方式，驗(yàn)證流程復(fù)雜度較高。

從頭測(cè)序不僅是一項(xiàng)分析技術(shù)，更是突破數(shù)據(jù)庫(kù)壁壘、探索未知dànbáizhì結(jié)構(gòu)與功能的戰(zhàn)略路徑。在dànbáizhì組學(xué)研究日益向個(gè)性化、多樣化、非標(biāo)準(zhǔn)化方向發(fā)展的趨勢(shì)下，從頭測(cè)序的重要性將愈加突出。百泰派克生物科技圍繞質(zhì)譜組學(xué)技術(shù)不斷拓展，從平臺(tái)建設(shè)到算法優(yōu)化，為科研人員和企業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì)提供高質(zhì)量、高置信度的從頭測(cè)序服務(wù)，助力解析更廣闊的生物世界。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

從頭測(cè)序的優(yōu)勢(shì)與應(yīng)用領(lǐng)域檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹