基于iTRAQ的肽組學技術(shù)在炎癥研究中的
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- 公司名稱 北京百泰派克生物科技有限公司
- 品牌 百泰派克
- 型號
- 產(chǎn)地 中國
- 廠商性質(zhì) 其他
- 更新時間 2025/7/21 13:04:01
- 訪問次數(shù) 28
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業(yè)務范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務,為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務。
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基于iTRAQ的肽組學技術(shù)在炎癥研究中的應用檢測技術(shù)服務詳情介紹
iTRAQ同位素標記技術(shù),可對樣本中的肽段 N 端與賴氨酸側(cè)鏈進行共價標記,通過 4-plex 或 8-plex 多重標記,實現(xiàn)多樣品同時定量。在質(zhì)譜二級圖譜(MS/MS)中,這些同質(zhì)異構(gòu)的標簽裂解產(chǎn)生特征 reporter 離子,可用于jīngquè比較不同處理組的肽豐度。基于 iTRAQ 技術(shù)的肽組學在炎癥研究中應用廣泛,涵蓋機制探索、藥物反應監(jiān)測與生物標志物發(fā)現(xiàn),結(jié)合 PRM/ELISA 可實現(xiàn)科研與臨床的有效對接。
一、基于iTRAQ的肽組學技術(shù)為何適用于炎癥研究?
1、高通量比較能力:多樣本可在單次 LC-MS/MS 中同時分析,減少實驗偏差;
2、靈敏度與定量重現(xiàn)性高:相比標簽前方法,iTRAQ 可同時兼具定性與半定量能力;
3、對炎癥標志物探測高效:炎癥反應中,細胞因子、補體、炎癥相關(guān)酶和受體等成分動態(tài)變化顯著,iTRAQ 可捕捉這些低豐度變化。
二、基于iTRAQ的肽組學技術(shù)在炎癥研究中的應用
炎癥作為機體對感染、損傷或免疫刺激的高度復雜反應過程,涉及大量可溶性因子(如細胞因子、趨化因子、補體蛋白)、受體和信號轉(zhuǎn)導通路的動態(tài)調(diào)控。傳統(tǒng)手段難以全面捕捉這些多維動態(tài)變化,而 iTRAQ 技術(shù)結(jié)合高分辨質(zhì)譜,為炎癥過程的系統(tǒng)性研究提供了強有力的技術(shù)支持。
1、揭示炎癥介質(zhì)的表達變化
通過對不同處理組肽段進行等摩爾標記,在一次 LC-MS/MS 分析中實現(xiàn)多樣本平行定量,大幅提升了通量和比較效率。在炎癥研究中,該技術(shù)可廣泛應用于分析以下炎癥相關(guān)因子:基于iTRAQ的肽組學技術(shù)
(1)急性期蛋白(如 C-反應蛋白、血清淀粉樣蛋白等):其表達動態(tài)變化可被jīngquè量化,用于判斷炎癥程度。
(2)細胞因子調(diào)控蛋白:包括IL-1/6調(diào)節(jié)因子、NF-κB信號調(diào)控因子、STAT相關(guān)通路蛋白等,可揭示免疫信號轉(zhuǎn)導異常機制。
(3)細胞凋亡與自噬相關(guān)因子:炎癥狀態(tài)下細胞命運變化的重要調(diào)節(jié)蛋白(如 caspase、Beclin-1)也可通過 iTRAQ 分析其豐度變化。
2、炎癥通路富集與網(wǎng)絡建模
通過 iTRAQ 數(shù)據(jù)結(jié)合生物信息學分析,可識別在炎癥狀態(tài)下顯著上調(diào)或下調(diào)的多肽,并進一步進行功能注釋與通路富集(如 KEGG/GO 分析):
(1)識別激活通路:如 TNF-α/NF-κB、JAK/STAT、MAPK、NLRP3 炎癥小體等關(guān)鍵炎癥反應通路。
(2)調(diào)控模塊重構(gòu):通過蛋白互作網(wǎng)絡(PPI)分析構(gòu)建炎癥調(diào)控網(wǎng)絡,挖掘關(guān)鍵 hub 蛋白。
(3)靶點預篩:依據(jù)表達趨勢與網(wǎng)絡中心度,鎖定潛在治療干預靶點。
3、疾病狀態(tài)分型與分期
iTRAQ 肽組學還可用于炎癥性疾病的分型研究,例如:
(1)輕度與重度炎癥對比:通過定量差異分析,找出病程早期與進展期關(guān)鍵表達變化分子;
(2)治療響應預測:基于 iTRAQ 數(shù)據(jù)構(gòu)建生物標志物組合,預測個體對抗炎藥物、免疫抑制劑等療效;
(3)慢性與急性炎癥鑒別:識別特異分子模式(molecular signature),用于疾病類型分類或分期參考。
4、聯(lián)合多組學揭示炎癥網(wǎng)絡
在當前精密醫(yī)學趨勢下,iTRAQ 肽組學常與其他組學數(shù)據(jù)(如轉(zhuǎn)錄組、代謝組、磷酸化組等)聯(lián)合分析:
(1)蛋白–mRNA 協(xié)同表達分析:判定蛋白豐度變化是否由轉(zhuǎn)錄水平驅(qū)動,篩選轉(zhuǎn)錄后調(diào)控目標;
(2)蛋白–代謝通路聯(lián)動:揭示炎癥狀態(tài)下的能量代謝重編程(如乳酸代謝、脂肪酸氧化);
(3)與表觀修飾組協(xié)同:結(jié)合乙?;?磷酸化組學,闡明炎癥信號傳導蛋白的修飾調(diào)控網(wǎng)絡。
5、炎癥標志物發(fā)現(xiàn)與轉(zhuǎn)化應用
通過 iTRAQ 篩選出的差異表達多肽,可進一步通過靶向質(zhì)譜(如 PRM/MRM)或免疫學手段(如 ELISA)進行驗證,推動以下轉(zhuǎn)化應用:
(1)炎癥診斷標志物開發(fā):挖掘可用于血液、尿液等樣本中檢測的非侵入性炎癥生物標志物;
(2)個體化治療靶點發(fā)現(xiàn):識別疾病亞群的特異性調(diào)控因子,指導靶向治療;
(3)藥效學評價指標建立:作為藥物作用機制確認與療效監(jiān)測的可靠定量指標。
三、基于iTRAQ的肽組學技術(shù)實驗流程詳解
1、樣本處理:提取血清、組織或細胞裂解液。
2、蛋白酶解:使用yídànbáiméi消化,生成可標記肽段。
3、iTRAQ 標記:分別將不同處理組肽段用各通道標簽標記,如 113–118。
4、樣本混合與預分離:混樣后通過 HILIC 或 SCX 分級,減少樣本復雜度。
5、LC-MS/MS 檢測:選用高分辨 Orbitrap 聯(lián)盟 MS 進行多輪數(shù)據(jù)收集。
6、數(shù)據(jù)分析:利用 Mascot、MaxQuant 等平臺進行賴氨酸肽識別與 reporter 離子峰定量。
7、差異蛋白篩選:選取 fold change ≥1.2 或 ≤0.83,結(jié)合 P 值和 FDR 校正。
8、通路富集分析:應用 GO 與 KEGG 注釋解析炎癥相關(guān)通路。
9、靶向驗證:使用 PRM 或 ELISA 對關(guān)鍵炎癥蛋白進行驗證與二次鑒定。
百泰派克生物科技助力炎癥研究
百泰派克生物科技擁有完善的 iTRAQ 標記與 LC-MS/MS 平臺能力:高通量方案,適應多樣本對比;豐富數(shù)據(jù)處理與生信分析經(jīng)驗,提供通路富集與靶點挖掘報告;提供驗證性 PRM/ELISA 服務,支撐臨床轉(zhuǎn)化;完整 QC 流程,符合 GLP/GCLP 標準,確保臨床級數(shù)據(jù)質(zhì)量。
基于iTRAQ的肽組學技術(shù)在炎癥研究中應用廣泛,涵蓋機制探索、藥物反應監(jiān)測與生物標志物發(fā)現(xiàn),結(jié)合 PRM/ELISA 可實現(xiàn)科研與臨床的有效對接。百泰派克生物科技憑借成熟平臺和zhuānyè團隊,可為客戶提供 iTRAQ 全流程解決方案,助力精密炎癥分析、標志物開發(fā)與診斷轉(zhuǎn)化。如果您有炎癥相關(guān)研究需求,歡迎聯(lián)系我們,共同推動炎癥科研與臨床應用創(chuàng)新。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優(yōu)勢:
1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。
三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務優(yōu)勢:
1.技術(shù)*,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;
3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!