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如何通過Edman降解實現(xiàn)高效蛋白質(zhì)序列

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百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務。

l 公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;

l 獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;

l 業(yè)務范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;

l 7大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;

l 服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

l 致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!






業(yè)務范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結構解析等相關技術服務,為客戶提供高性價比、高效率的技術服務。

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如何通過Edman降解實現(xiàn)高效蛋白質(zhì)序列分析?實驗室指南檢測技術服務詳情介紹

Edman降解是一種經(jīng)典且高度特異的dànbáizhìN端序列分析技術,至今仍在結構dànbáizhì組學、抗體工程與生物藥研發(fā)中扮演著重要角色。盡管高分辨率質(zhì)譜技術日新月異,Edman降解因其對N端氨基酸的逐步解析能力,在某些特定應用場景中仍具有bùkětìdài的價值。本文將從實驗原理、操作流程、樣本準備、結果解析及常見問題出發(fā),系統(tǒng)解析如何高效開展Edman降解實驗,助力科研人員獲得可靠的dànbáizhì序列信息。


一、什么是Edman降解?

Edman降解由Pehr Edman于1950年提出,是一種通過周期性化學反應從多肽N端逐個釋放氨基酸殘基并進行鑒定的技術。它的核心在于利用酚異硫氰酸酯(PITC)與N端氨基酸反應,形成可被裂解和分析的衍生物,從而實現(xiàn)序列的“逐步拆解”。與質(zhì)譜分析不同,Edman降解不依賴質(zhì)量電荷比(m/z),而是基于化學選擇性,因而在已知目標蛋白并需要驗證N端完整性、識別修飾或突變時尤為有效。


二、Edman降解的適用場景

雖然現(xiàn)代dànbáizhì組學多依賴質(zhì)譜,但Edman降解仍在以下情境中發(fā)揮著dútè優(yōu)勢:


  • 重組蛋白或單克隆抗體的N端驗證

  • 蛋白修飾或截斷的鑒定

  • 用于驗證質(zhì)譜推測結果的準確性

  • 無法離子化或質(zhì)譜響應弱的樣本


在百泰派克生物科技的實際項目中,我們常結合Edman降解與質(zhì)譜分析交叉驗證dànbáizhì序列,提升結果的可靠性。


三、Edman降解的基本流程

1、樣本固定(Immobilization)

Edman降解通常要求樣品被固定在聚偏二氟乙烯(PVDF)膜或玻璃纖維片上,防止反應中蛋白丟失。通常通過SDS-PAGE轉(zhuǎn)膜完成,需避免使用干擾化學物質(zhì)如Tween-20。


2、N端氨基酸衍生化

使用酚異硫氰酸酯(PITC)與N端氨基反應,形成環(huán)狀PTH氨基酸衍生物。該反應在堿性條件下進行,對水敏感,因此對環(huán)境控制較為嚴格。


3、裂解與回收

加入無水酸使肽鏈裂解,釋放PTH氨基酸。該步驟需高效回收PTH產(chǎn)物以確保后續(xù)分析的靈敏度。


4、分析與鑒定

利用高效液相色譜(HPLC)或毛細管電泳分析PTH衍生物,通過保留時間匹配標準氨基酸來確認N端序列。


四、實驗成功的關鍵因素

為了獲得高質(zhì)量的序列數(shù)據(jù),以下幾點尤為關鍵:

1、樣本純度

Edman降解對樣本純度要求jígāo。混雜蛋白會導致多重信號干擾,影響序列判斷。


2、N端可接近性

如果N端被封閉(如乙?;?、修飾或信號肽未切除),將無法進行Edman降解。預處理酶切或化學去修飾可能是必要步驟。


3、轉(zhuǎn)膜完整性

蛋白在電泳后轉(zhuǎn)膜過程中若發(fā)生降解或遷移失敗,亦會影響反應效率。


4、每循環(huán)反應效率

隨著反應周期增加,降解效率會逐步下降。通常建議讀取qián10–20個氨基酸。


五、Edman降解 vs 質(zhì)譜:如何選擇?


如何通過Edman降解實現(xiàn)高效蛋白質(zhì)序列

建議策略: 若關注N端序列完整性或修飾,Edman降解是優(yōu)選方法;若需獲取整體序列或高通量分析,質(zhì)譜更具優(yōu)勢。在百泰派克生物科技,我們提供Edman降解與高分辨質(zhì)譜相結合的綜合dànbáizhì測序方案,為客戶定制zuì合適的策略。


在百泰派克,我們擁有:


  • 自動化Edman降解儀

  • 標準化PVDF轉(zhuǎn)膜流程與樣本前處理體系

  • 與高分辨質(zhì)譜聯(lián)合驗證方案

  • 支持科研項目申報的完整技術資料與報告交付


無論您是進行單抗質(zhì)量驗證、N端修飾檢測,還是為藥物申報準備質(zhì)量研究數(shù)據(jù),我們都可提供高靈敏、高可靠的dànbáizhì序列分析服務。


盡管Edman降解是一項“老牌技術”,但其在dànbáizhìN端序列解析領域仍具有dútè價值。尤其在結構驗證、生物制藥質(zhì)控和蛋白工程中,準確的N端信息往往是不可忽視的關鍵。如果您正在尋找高效、jīngzhǔn、可驗證的dànbáizhì序列分析服務,歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技。我們不僅提供技術,更提供zhídexìnlài的數(shù)據(jù)支持與科研合作伙伴關系。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。


※服務優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。


※服務優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務優(yōu)勢:

1.技術先進,填補技術空白

采用金屬標記抗體技術,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

如何通過Edman降解實現(xiàn)高效蛋白質(zhì)序列




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;

5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!



如何通過Edman降解實現(xiàn)高效蛋白質(zhì)序列分析?實驗室指南檢測技術服務詳情介紹



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