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疏水色譜：
疏水色譜基于蛋白質(zhì)表面的疏水區(qū)與介質(zhì)疏水配體間的相互作用，在高濃度鹽作用下，蛋白質(zhì)的疏水區(qū)表面上有序排列的水分子通過鹽離子的破壞被釋放，裸露的疏水區(qū)與疏水配體相互作用而被吸附。疏水色譜就是利用樣品中各組分在色譜填料上配基相互作用的差異，在洗脫時各組分移動速度不同而達到分離的目的。隨著鹽離子濃度的降低，疏水作用降低，蛋白質(zhì)的水化層又形成，蛋白質(zhì)被解吸附。
親和色譜：
生物大分子有一個特性，某些分子或基因?qū)λ鼈冇刑禺愋院軓姷奈阶饔?。如鎳柱?/font>Ni可以與His標(biāo)簽的蛋白結(jié)合，這種只針對一種或一類物質(zhì)的吸附就是親和色譜的原理。
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