基于DIA/SWATH的蛋白質(zhì)翻譯后修飾定量分析檢測技術(shù)服務詳情介紹

dànbáizhì翻譯后修飾（Post-Translational Modifications, PTMs）在調(diào)控細胞功能、信號轉(zhuǎn)導、代謝過程及疾病發(fā)生中扮演著核心角色。磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等修飾形式，為dànbáizhì賦予了時空特異性和功能多樣性，是理解蛋白功能狀態(tài)的重要線索。隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展，數(shù)據(jù)獨立采集（Data-Independent Acquisition, DIA）尤其是SWATH-MS（Sequential Windowed Acquisition of All Theoretical Fragment Ion Mass Spectra）策略，正在成為PTM定量研究的重要手段，以其高通量、高重復性、無偏性等特點，助力科研人員實現(xiàn)對復雜生物樣本中修飾蛋白的系統(tǒng)解析。

一、dànbáizhì翻譯后修飾的復雜性與挑戰(zhàn)

dànbáizhì翻譯后修飾具有高度復雜性。一方面，多種修飾類型可作用于同一蛋白甚至同一氨基酸殘基上，形成調(diào)控的協(xié)同或拮抗作用；另一方面，修飾通常以低豐度存在，且變化迅速，受細胞狀態(tài)、外部刺激和發(fā)育階段影響顯著。此外，修飾位點的異構(gòu)性也對分析提出了更高的分辨需求。在識別和定量這類修飾分子時，常受限于數(shù)據(jù)獲取的片段性和樣本重復性不高等問題，難以滿足系統(tǒng)性研究的需求。基于DIA/SWATH的質(zhì)譜采集方式，恰好以其覆蓋全面、定量jīngquè的特性，為翻譯后修飾研究打開了新的可能性。

二、DIA/SWATH-MS：構(gòu)建高維度的修飾dànbáizhì組數(shù)據(jù)

DIA/SWATH技術(shù)的基本原理是將整個質(zhì)譜掃描范圍劃分為若干窗口，依次對所有窗口內(nèi)的前體離子進行同步碎裂，并采集其全部MS/MS信息。這種采集策略不依賴前體強度，不會遺漏低豐度信號，能夠在同一次分析中獲取完整的片段譜圖，從而實現(xiàn)對樣本中所有可檢測肽段的無偏分析。

在翻譯后修飾研究中，這種采集模式帶來了三大關(guān)鍵優(yōu)勢：

1、全面性與一致性

所有樣本在相同條件下均被采集相同的數(shù)據(jù)維度，顯著提升了不同實驗批次、不同處理組間數(shù)據(jù)的可比性和穩(wěn)定性。這對于動態(tài)修飾事件的追蹤，如藥物處理、細胞周期、炎癥應答等研究場景尤為重要。

2、位點級別的修飾信息捕獲

PTM定量的核心不僅在于檢測修飾肽段，更在于jīngquè定位修飾位點。DIA數(shù)據(jù)的高覆蓋度使得研究人員可以借助高質(zhì)量的譜圖庫或預測算法，對修飾位點進行準確判定，實現(xiàn)從肽段層面向位點層面的深入拓展。

3、適配復雜樣本和多條件比較

在多組樣本、多種處理條件的大規(guī)模實驗設計中，DIA數(shù)據(jù)具有良好的批間一致性和高通量處理能力，可有效支持多變量統(tǒng)計分析、時間序列建模和系統(tǒng)生物學網(wǎng)絡構(gòu)建。

三、DIA在翻譯后修飾研究中的關(guān)鍵流程

DIA/SWATH技術(shù)的高效運用，需依賴一整套優(yōu)化流程，從樣本前處理到數(shù)據(jù)分析，環(huán)環(huán)相扣。

1、修飾肽段的特異性富集

翻譯后修飾常表現(xiàn)為低豐度、短暫且易受環(huán)境影響。為增強其在質(zhì)譜中的檢測能力，富集策略是dìyī道“篩選門檻”。例如，磷酸化通常使用金屬離子親和層析（IMAC）或èryǎnghuàtài（TiO?）富集，乙酰化與泛素化則常依賴于特異性抗體進行免疫富集。高選擇性與低非特異性結(jié)合率，是確保DIA分析成功的基礎。

2、DIA譜圖庫構(gòu)建與修飾信息整合

在DIA分析中，譜圖庫是實現(xiàn)修飾肽段識別與定量的核心資源?？刹捎脙煞N方式進行構(gòu)建：

• 實驗譜庫：通過前期DDA實驗獲取修飾肽段的碎片譜圖，構(gòu)建針對性強的定制庫；

• 預測譜庫：利用機器學習模型（如Prosit、DIA-NN）根據(jù)肽段序列預測其MS/MS特征，快速生成大規(guī)模、高覆蓋率的修飾譜庫。

高質(zhì)量的譜圖庫，能顯著提升修飾肽段的檢出率和定量精度，尤其對于未知修飾位點的探索具有重要意義。

3、數(shù)據(jù)分析與生物學解釋

PTM數(shù)據(jù)分析不僅關(guān)注定量水平的變化，更強調(diào)生物學意義的挖掘。例如：

• 位點特異性差異分析：識別在不同條件下顯著變化的修飾位點；

• 修飾網(wǎng)絡構(gòu)建：解析特定修飾類型在信號通路、轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的參與角色；

• 修飾間交互研究：探索磷酸化與乙?；?、泛素化之間的協(xié)同或競爭作用。

目前，已有多種專門用于DIA數(shù)據(jù)的分析軟件支持PTM研究（如Spectronaut、DIA-NN、Skyline），可幫助科研人員從復雜數(shù)據(jù)中提取具有生物學意義的修飾信號。

基于DIA/SWATH的dànbáizhì翻譯后修飾定量分析使研究者能夠在大規(guī)模樣本中穩(wěn)定、準確地識別和量化修飾位點，推動生命科學從“結(jié)構(gòu)識別”走向“功能解碼”。百泰派克生物科技致力于為科研工作者提供高質(zhì)量的SWATH定量蛋白組學服務，助力探索蛋白修飾的精細調(diào)控機制，共同推進生命科學的邊界。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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