常用CD光譜分析工具怎么選？BeStSel與DichroWeb對比解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在結(jié)構(gòu)生物學和dànbáizhì研究中，圓二色性（Circular Dichroism, CD）光譜是一種重要的工具，廣泛應(yīng)用于dànbáizhì二級結(jié)構(gòu)分析、構(gòu)象變化監(jiān)測以及熱穩(wěn)定性評估。CD光譜提供了對dànbáizhì折疊狀態(tài)的快速、非破壞性檢測手段，但其數(shù)據(jù)解讀高度依賴于計算工具和算法的支持。當前主流的CD數(shù)據(jù)分析平臺包括BeStSel和DichroWeb，兩者均被廣泛采用，卻在算法原理、分析精度和適用場景上各有千秋。本文將圍繞“CD光譜分析工具怎么選”這一核心問題，從功能、算法精度、適配性等維度對BeStSel與DichroWeb進行深入解析，為結(jié)構(gòu)生物學研究人員提供實用參考。

一、什么是CD光譜分析？為什么離不開計算工具？

CD光譜是由手性分子對圓偏振光吸收差異產(chǎn)生的譜圖，dànbáizhì的不同二級結(jié)構(gòu)（α-螺旋、β-折疊、無規(guī)卷曲）在190–260 nm波長區(qū)間具有特征信號。由于CD信號強度弱且各結(jié)構(gòu)的譜圖高度重疊，單靠肉眼難以jīngquè判斷蛋白結(jié)構(gòu)組成比例，這便凸顯了計算工具的重要性。

※ 理想的CD分析工具應(yīng)具備以下特征：

• 高準確性：可區(qū)分相似的結(jié)構(gòu)特征，如平行與反平行β折疊；

• 高通量兼容性：支持批量分析與自動化處理；

• 數(shù)據(jù)庫依賴度低：避免因參考數(shù)據(jù)庫偏差導致的誤判；

• 用戶友好性強：便于非結(jié)構(gòu)生物學背景的研究者操作。

二、BeStSel：結(jié)構(gòu)解析的“β折疊專家”

※ 核心優(yōu)勢

BeStSel（Beta Structure Selection）專為高分辨β結(jié)構(gòu)判定而設(shè)計，特別適用于富含β-結(jié)構(gòu)的dànbáizhì。其算法不僅識別總β含量，還能進一步細分為平行與反平行構(gòu)型，解決了傳統(tǒng)算法難以區(qū)分β類型的難題。

• dútè算法：基于廣泛的實驗參考光譜庫，結(jié)合支持向量機（SVM）回歸優(yōu)化，提升分類準確率。

• 結(jié)構(gòu)敏感性強：尤其在β-結(jié)構(gòu)占比高的蛋白中表現(xiàn)出色。

• 支持跨物種數(shù)據(jù)：算法不依賴單一數(shù)據(jù)庫，適配多種生物樣本。

※ 潛在局限

BeStSel對α-螺旋富集蛋白的適配性相對較弱，若研究對象為膜蛋白或天然無序蛋白，建議搭配其他工具輔助分析。

三、DichroWeb：通用型CD數(shù)據(jù)處理平臺

※ 核心優(yōu)勢

DichroWeb是一個成熟的CD光譜分析平臺，提供多種算法選擇（如CONTIN、CDSSTR、SELCON3等），適合大多數(shù)水溶性蛋白的結(jié)構(gòu)評估。其優(yōu)勢在于算法靈活性高、參考數(shù)據(jù)庫豐富，尤其適合進行批量數(shù)據(jù)比對和交叉驗證。

• 多算法支持：可根據(jù)樣本特性選擇zuì適合的擬合模型。

• 操作界面友好：支持在線數(shù)據(jù)提交和圖形化輸出結(jié)果。

• 數(shù)據(jù)庫quánwēi：集成多個經(jīng)驗證的數(shù)據(jù)集，提高預測穩(wěn)定性。

※ 潛在局限

DichroWeb對jíduān結(jié)構(gòu)或人工dànbáizhì的分析準確性有所下降，且較依賴參考數(shù)據(jù)庫的代表性。

四、BeStSel vs.DichroWeb：怎么選？

CD光譜作為蛋白結(jié)構(gòu)研究中的常規(guī)技術(shù)，其分析質(zhì)量高度依賴工具算法的選擇與使用策略。BeStSel和DichroWeb各具優(yōu)勢，并非互斥，而是應(yīng)被視為互補的分析組件。在未來的結(jié)構(gòu)生物學研究中，合理整合多工具的能力將直接決定數(shù)據(jù)解釋的深度與準確性。百泰派克生物科技構(gòu)建了完善的CD數(shù)據(jù)分析與結(jié)構(gòu)預測服務(wù)體系，結(jié)合自主優(yōu)化的數(shù)據(jù)處理流程與多平臺工具互補機制，確?？蛻臬@得更加jīngquè且可重復的蛋白結(jié)構(gòu)信息。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)先進，填補技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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