▍參考文獻(xiàn) 

1、Deep whole-genome analysis of 494 hepatocellular carcinomas

DOI:10.1038/s41586-024-07054-3

地球超過一半的肝細(xì)胞癌（HCC）病例發(fā)生在中國，但目前針對中國人群中乙型肝炎病毒（HBV）相關(guān)HCC的全基因組分析研究非常有限。為了突破這種限制，研究人員啟動了“中國肝癌圖譜項(xiàng)目”（CLCA），旨在對中國人群中的HCC進(jìn)行大規(guī)模的全基因組分析以理解其不同的發(fā)病機(jī)制和進(jìn)化過程。該項(xiàng)目對494例HCC腫瘤樣本進(jìn)行了深度全基因組測序（平均測序深度為120×），并分析了匹配的對照血液樣本，揭示了HBV相關(guān)HCC的詳細(xì)基因組特征。研究發(fā)現(xiàn)，除了已知的編碼區(qū)驅(qū)動基因（如TP53和CTNNB1）外，還存在6個新的編碼區(qū)驅(qū)動基因（包括FGA）和31個非編碼區(qū)驅(qū)動基因。此外，研究還揭示5種新的突變特征（包括SBS_H8），以及HBV整合形成細(xì)胞外環(huán)狀DNA（ecDNA）的現(xiàn)象，這些ecDNA可導(dǎo)致癌基因擴(kuò)增和表達(dá)增加。通過功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，研究人員證實(shí)了FGA、PPP1R12B和KCNJ12等基因的突變能夠顯著影響HCC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力。這項(xiàng)研究結(jié)果不僅豐富了人們對HCC基因組學(xué)的理解，也為HCC的診斷和治療提供了新的潛在靶點(diǎn)。

候選驅(qū)動因子概況

2、Targeted Macrophage CRISPR-Cas13 mRNA Editing in Immunotherapy for Tendon Injury

DOI:10.1002/adma.202311964

肌腱損傷急性炎癥期中，巨噬細(xì)胞過度激活會導(dǎo)致編碼骨橋蛋白OPN的SPP1過表達(dá)，影響組織再生。CRISPR-Cas13由于具有RNA編輯和快速降解的能力，在組織修復(fù)方面具有巨大潛力，但缺乏合適有效的遞送方法。對此，研究人員系統(tǒng)篩選了針對巨噬細(xì)胞的陽離子聚合物，開發(fā)了一種能夠高效遞送Cas13核糖核蛋白復(fù)合物（Cas13 RNP）進(jìn)入巨噬細(xì)胞的納米簇載體。通過反應(yīng)性氧種（ROS）響應(yīng)性釋放機(jī)制，該系統(tǒng)能夠在肌腱損傷的急性炎癥微環(huán)境中特異性抑制巨噬細(xì)胞中SPP1的過表達(dá)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，這種靶向策略顯著減少了損傷誘導(dǎo)的SPP1產(chǎn)生巨噬細(xì)胞的出現(xiàn)，降低了成纖維細(xì)胞的激活，并減輕了肌腱周圍的粘連形成。此外，該研究還揭示了SPP1通過CD44/AKT信號通路促進(jìn)成纖維細(xì)胞活化和遷移的機(jī)制，并通過抑制這一通路有效緩解了肌腱損傷后的粘連問題。

用于PA治療的巨噬細(xì)胞免疫微環(huán)境激活mRNA編輯策略的示意圖

3、Electrical stimulation of piezoelectric BaTiO3 coated Ti6Al4V scaffolds promotes anti-inflammatory polarization of macrophage and bone repair via MAPK/JNK inhibition and OXPHOS activation

DOI:10.1016/j.biomaterials.2022.121990

脊髓損傷（SCI）是一種導(dǎo)致感覺自主神經(jīng)和運(yùn)動功能的長久性損害的嚴(yán)重致殘性疾病。干細(xì)胞療法，尤其是間充質(zhì)干細(xì)胞（MSCs），在SCI治療中展現(xiàn)出巨大潛力但其再生能力有限，這限制了其在組織再生中的應(yīng)用。研究團(tuán)隊(duì)觀察到ABPCs衍生的EVs（EVsABPC）可能攜帶促進(jìn)組織再生的生物活性信號，因此他們從鹿角芽基祖細(xì)胞（ABPCs）中提取并修飾了細(xì)胞外囊泡（EVsABPC），并將其應(yīng)用于脊髓損傷（SCI）的治療研究。研究人員發(fā)現(xiàn)EVsABPC能夠顯著增強(qiáng)神經(jīng)干細(xì)胞（NSCs）的增殖，促進(jìn)軸突生長，減少神經(jīng)元凋亡，并通過調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)將巨噬細(xì)胞從促炎的M1型極化為抗炎的M2型。此外，經(jīng)過工程化改造的EVsABPC（通過激活細(xì)胞穿透肽修飾）能夠更有效地靶向SCI損傷部位，顯著改善神經(jīng)再生和運(yùn)動功能恢復(fù)。這些結(jié)果表明，EVsABPC是一種具有潛力的SCI治療候選方案。

圖解摘要

4、Dumbbell probe initiated multi-rolling circle amplification assisted CRISPR/Cas12a for highly sensitive detection of clinical microRNA

DOI:10.1016/j.bios.2024.116676

微小RNA（miRNA）是一類小的非編碼RNA分子，通過與特定靶基因的信使RNA（mRNA）相互作用來調(diào)控基因表達(dá)。miRNA在多種疾病的發(fā)生、發(fā)展過程中扮演著重要角色，被認(rèn)為是具有潛力的疾病生物標(biāo)志物。該研究利用CRISPR/Cas12a開發(fā)了一種為DBmRCA的新型miRNA檢測技術(shù)。該技術(shù)利用無連接酶的啞鈴探針和高靈敏度的CRISPR/Cas12a信號輸出策略，實(shí)現(xiàn)了在30分鐘內(nèi)對miRNA的高精度定量分析。研究團(tuán)隊(duì)通過臨床樣本驗(yàn)證了該技術(shù)的有效性，發(fā)現(xiàn)miR-200a和miR-126在肺癌組織中的表達(dá)水平顯著降低，且該技術(shù)與傳統(tǒng)方法結(jié)果一致。DBmRCA技術(shù)具有時(shí)間效率高、靈敏度強(qiáng)和操作流程簡化等優(yōu)點(diǎn)，為臨床miRNA分析提供了一種可靠的工具，有望助力肺癌的早期診斷和治療。

圖解摘要