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化繁為簡(jiǎn)！小翊帶你輕松搞定qPCR數(shù)據(jù)分析2019/07/29: 化繁為簡(jiǎn)！小翊帶你輕松搞定qPCR數(shù)據(jù)分析熒光定量PCR（qPCR）是實(shí)驗(yàn)室常用的一種技術(shù)，該技術(shù)可以應(yīng)用于基因表達(dá)分析、基因分型、病原體檢測(cè)、SNP分析等。qPCR實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單，原理易懂，但面對(duì)一堆凌亂的數(shù)據(jù)，如何進(jìn)行結(jié)果分析成了頭疼的問(wèn)題，今天小翊將帶你學(xué)會(huì)如何化繁為簡(jiǎn)，輕松獲得可以發(fā)表SCI的數(shù)據(jù)！qPCR常用的分析方法有相對(duì)定量和定量，需根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)進(jìn)行選擇。本期我們關(guān)注的是qPCR常見(jiàn)的應(yīng)用—基因表達(dá)分析，一般選擇相對(duì)定量法。1.實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)假設(shè)目前需要研究光誘導(dǎo)對(duì)擬南芥AtSUC2

活細(xì)菌/死細(xì)菌染色試劑盒2019/07/22: 產(chǎn)品信息產(chǎn)品名稱(chēng)產(chǎn)品編號(hào)規(guī)格儲(chǔ)存價(jià)格Live&DeadBacterialStainingKit活細(xì)菌/死細(xì)菌染色試劑盒40274ES60100T4℃避光保存3683.00產(chǎn)品描述試劑盒內(nèi)含兩種熒光染料DMAO和EthD-III，可分別將活細(xì)菌和死細(xì)菌染上綠色和紅色。其中DMAO是一種綠色核酸熒光染料，可染色活細(xì)菌和死細(xì)菌。EthD-III是一種紅色核酸熒光染料，僅染色細(xì)胞膜受損的死細(xì)菌。將DMAO和EthD-III混合使用染色時(shí)具有完整細(xì)胞膜的細(xì)菌呈現(xiàn)綠色，而具有受損細(xì)胞膜的細(xì)菌呈現(xiàn)綠色和紅色。

新品推薦|反轉(zhuǎn)、高質(zhì)量cDNA，用Yeasen第三代逆轉(zhuǎn)錄酶預(yù)混液2019/07/17: 新品推薦|反轉(zhuǎn)、高質(zhì)量cDNA，用Yeasen第三代逆轉(zhuǎn)錄酶預(yù)混液你的逆轉(zhuǎn)錄，交給YEASEN三代逆轉(zhuǎn)錄酶來(lái)守護(hù)！Hifair®Ⅲ1stStrandcDNASynthesisSuperMixforqPCR(gDNAdigesterplus)是基于翊圣Hifair®ⅢReverseTranscriptase而開(kāi)發(fā)的即用型預(yù)混液。該產(chǎn)品可耐受高達(dá)65℃的反應(yīng)溫度，適合具有復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄；同時(shí)增強(qiáng)了與模板的親和力，非常適合少量模板以及低拷貝基因的逆轉(zhuǎn)錄。產(chǎn)品帶基因組DNA去除成分，適

活死細(xì)菌、細(xì)胞檢測(cè)——探尋生命的奧秘2019/07/17: 活死細(xì)菌、細(xì)胞檢測(cè)-----探尋生命的奧秘背景介紹真核生物（哺乳動(dòng)物細(xì)胞）和原核生物（細(xì)菌）細(xì)胞增殖和細(xì)胞死亡間平衡對(duì)維持細(xì)胞有機(jī)的發(fā)育與生命的維持至關(guān)重要，如果出現(xiàn)失衡將導(dǎo)致各種疾病的發(fā)生。活死狀態(tài)是研究生物增殖生長(zhǎng)的常見(jiàn)研究目的，例如；對(duì)于真核活死細(xì)胞主要通過(guò)分析細(xì)胞質(zhì)膜完整性與細(xì)胞內(nèi)酯酶活性，經(jīng)過(guò)特定儀器觀察判斷，為研究細(xì)胞狀態(tài)提供了一種方便的方法，同時(shí)分析活細(xì)胞與死細(xì)胞，用于評(píng)估細(xì)胞的活力。可以應(yīng)用于大多數(shù)的真核哺乳動(dòng)物細(xì)胞，但不適用于真菌和酵母。主要對(duì)于藥物研究、毒性判定、細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)

揭秘各種主流二代測(cè)序儀，無(wú)瓜攻略2019/07/10: 揭秘各種主流二代測(cè)序儀，無(wú)瓜攻略隨著基因領(lǐng)域研究的不斷深入，自sanger測(cè)序?qū)崿F(xiàn)對(duì)堿基信息的可讀取后，更高通量的需求使得二代測(cè)序在基因組測(cè)序、臨床檢測(cè)和生物制藥等領(lǐng)域展現(xiàn)出的潛力。對(duì)于剛?cè)胄械男』锇椋鎸?duì)各式各樣的測(cè)試平臺(tái)好奇又迷茫，Roche454、Illumina、ThermoFisher，以及國(guó)產(chǎn)MGI平臺(tái)等，這么多測(cè)序儀，他們的特點(diǎn)是什么？背后的發(fā)展歷程是怎樣的？今天小翊借花獻(xiàn)佛，梳理了目前主流的二代測(cè)序平臺(tái)，讓我們了解二代測(cè)序這十幾年的發(fā)展歷程。表1二代測(cè)序部分儀器展示備注：圖片來(lái)源

脂蛋白—研究代謝運(yùn)輸?shù)闹?/a>2019/06/25: 脂蛋白—研究代謝運(yùn)輸?shù)闹直尘敖榻B脂蛋白（lipoproteins），與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起形成的脂質(zhì)-蛋白質(zhì)復(fù)合物。脂蛋白中脂質(zhì)與蛋白質(zhì)之間沒(méi)有共價(jià)鍵結(jié)合，多數(shù)是通過(guò)脂質(zhì)的非極性部分與蛋白質(zhì)組分之間以疏水性相互作用而結(jié)合在一起。通常用溶解特性、離心沉降行為和化學(xué)組成來(lái)鑒定脂蛋白的特性。YEASEN（翊圣生物）致力于為診斷試劑公司和廣大科研用戶(hù)提供高品質(zhì)的低密度脂蛋白(LDL)和高密度脂蛋白（HDL）。產(chǎn)品應(yīng)用常規(guī)脂蛋白的應(yīng)用乙?；鞍椎膽?yīng)用氧化性脂蛋白的應(yīng)用相關(guān)產(chǎn)品（一）低密度脂蛋白低密度脂蛋白

qPCR文庫(kù)定量專(zhuān)題2019/06/20: HieffNGS®LibraryQuantificationKitforIllumina®——千真萬(wàn)確，精益求精產(chǎn)品簡(jiǎn)介本產(chǎn)品是用于lllumina®平臺(tái)高通量測(cè)序文庫(kù)濃度定量的試劑盒，提供定量所需的DNA標(biāo)準(zhǔn)品、qPCRMasterMix、定量擴(kuò)增引物和參比染料ROX。其中，DNA標(biāo)準(zhǔn)品包含經(jīng)梯度稀釋的六份450bp的雙鏈DNA//片段溶液，濃度為20pM-0.0002pM；擴(kuò)增引物對(duì)根據(jù)NGS文庫(kù)接頭序列P5和P7設(shè)計(jì)，可保證特異性擴(kuò)增雙端接頭完整的文庫(kù)分子；qPCRMasterMix是基于

快速型DNA建庫(kù)試劑盒2019/06/20: HieffNGS®FastTagmentDNALibraryPrepKit——快速型DNA建庫(kù)試劑盒產(chǎn)品描述HieffNGS®FastTagmentDNALibraryPrepKitforIllumina®是針對(duì)lllumina®高通量測(cè)序平臺(tái)專(zhuān)業(yè)開(kāi)發(fā)設(shè)計(jì)的轉(zhuǎn)座酶法建庫(kù)試劑盒。適用于1ng/50ng的基因組DNA、cDNA、擴(kuò)增子（500bp）等樣本的建庫(kù)。與常規(guī)分步法建庫(kù)相比，僅需10min即可完成DNA片段化、末端修復(fù)和接頭連接過(guò)程，顯著縮短建庫(kù)時(shí)間，并獲得優(yōu)異的測(cè)序質(zhì)量。產(chǎn)品原理在Tran

5 min了解DNA磁珠的前世今生2019/06/14: 磁珠是高通量測(cè)序過(guò)程*產(chǎn)品，通過(guò)磁顆粒活性基團(tuán)在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理，將樣本中目的片段分離?？蓪?shí)現(xiàn)對(duì)核酸樣本的高通量自動(dòng)化操作，廣泛應(yīng)用于基因測(cè)序以及分子診斷領(lǐng)域。背景篇磁珠的發(fā)明構(gòu)想初來(lái)自于挪威科技大學(xué)的化學(xué)家JohnUgelstad，他在1976年以聚苯乙烯為主要材料，制作出均勻磁化的球體粒子。1979年Vogelstein等報(bào)道在高濃度典化鈉存在的條件下，玻璃粉末作為吸附劑用于從瓊脂糖凝膠中提取DNA片段，而后基于硅膠和其他具有親水性表面載體的固相核酸純化技術(shù)廣泛發(fā)展起來(lái)。而

Benzonase Nuclease 核酸酶2019/06/12: 核酸酶，又稱(chēng)廣譜核酸酶，英文名稱(chēng)BenzonaseNuclease，一種來(lái)源于SerratiaMarcescen的非特異性核酸內(nèi)切酶，可在鏈內(nèi)任意核苷酸間進(jìn)行切割，將核酸*消化成3-8個(gè)堿基長(zhǎng)度的5'-單磷酸寡核苷酸，能夠在非常廣泛的條件下降解所有形式的（雙鏈，單鏈，線狀，環(huán)狀，天然或變性）DNA和RNA。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步，科學(xué)家對(duì)于效率的要求越來(lái)越高，在消耗同樣的時(shí)間和精力下，他們更愿意選擇快速，的方法。傳統(tǒng)核酸去除主要是超聲法和DNase/RNase酶法，因?yàn)閷?duì)應(yīng)的實(shí)驗(yàn)周期長(zhǎng)、去除效率低，

NGS文庫(kù)構(gòu)建產(chǎn)品選擇指南2019/05/30: NGS文庫(kù)構(gòu)建產(chǎn)品選擇指南YEASEN與NGS高通量測(cè)序是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的革命性創(chuàng)新，大力推動(dòng)了科學(xué)技術(shù)的發(fā)展。Yeasen長(zhǎng)期以來(lái)一直對(duì)高通量測(cè)序技術(shù)保持高度關(guān)注。自2009年成立以來(lái)，公司致力于分子酶的創(chuàng)新開(kāi)發(fā)，結(jié)合自身多年分子酶研發(fā)經(jīng)驗(yàn)，集結(jié)了在基因組學(xué)和生物信息學(xué)等領(lǐng)域有豐富經(jīng)驗(yàn)的科研人員組建了高通量測(cè)序研發(fā)團(tuán)隊(duì)，成功推出了高通量測(cè)序上游樣本文庫(kù)制備的完整產(chǎn)品線。不僅可以提供的建庫(kù)試劑盒，同時(shí)還可以根據(jù)客戶(hù)的需求定制開(kāi)發(fā)測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品。廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)檢測(cè)、科學(xué)研究等各個(gè)領(lǐng)域。公司注重產(chǎn)品品

qPCR進(jìn)階攻略——帶你玩轉(zhuǎn)儀器設(shè)置！2019/05/20: 熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)是分子實(shí)驗(yàn)室常用的一項(xiàng)技術(shù)。持續(xù)關(guān)注小翊的應(yīng)該都掌握了高質(zhì)量cDNA的獲取方法，引物設(shè)計(jì)指南以及反應(yīng)體系的配制技巧（還未get的小伙伴戳文末鏈接），然而上機(jī)時(shí)，發(fā)現(xiàn)和別人的反應(yīng)條件不一致卻又不敢動(dòng)儀器？本期小翊將帶你玩轉(zhuǎn)qPCR儀器的設(shè)置！目前市面上的qPCR儀器種類(lèi)五花八門(mén)，但基本上儀器的設(shè)置都相對(duì)一致。我們以ABI7500為例進(jìn)行介紹。反應(yīng)板設(shè)置實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇：我們將實(shí)驗(yàn)命名為“Yeasen”，進(jìn)行“Quantitation：ΔΔCt”實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)方法選擇：如選用SYBRGre

測(cè)序數(shù)據(jù)不好？是不是建庫(kù)出了問(wèn)題？！2019/05/17: HB190313測(cè)序數(shù)據(jù)不好？是不是建庫(kù)出了問(wèn)題？！——從測(cè)序數(shù)據(jù)看文庫(kù)構(gòu)建高通量測(cè)序中的文庫(kù)構(gòu)建指的是在DNA兩端連接特定的接頭從而使其符合測(cè)序平臺(tái)要求的過(guò)程，在高通量測(cè)序過(guò)程中，文庫(kù)質(zhì)量直接影響終測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量，打個(gè)比方，如果文庫(kù)上機(jī)測(cè)序的濃度很低，樣本在FlowCell上擴(kuò)增所形成的DNA樣本簇就會(huì)很少，測(cè)序數(shù)據(jù)量也將減少，這就可能導(dǎo)致測(cè)序失敗，所以我們說(shuō)文庫(kù)的質(zhì)量控制和質(zhì)量評(píng)估也是NGS中的關(guān)鍵步驟。文庫(kù)如何質(zhì)控？評(píng)估文庫(kù)質(zhì)量的方法有哪些？n文庫(kù)質(zhì)控：文庫(kù)在上機(jī)之前都有會(huì)進(jìn)行質(zhì)量檢測(cè)，質(zhì)

這有一份FFPE樣本建庫(kù)的檔案，還不趕緊Pick?2019/05/17: 這有一份FFPE樣本建庫(kù)的檔案，還不趕緊Pick?什么是FFPE？FFPE（Formalin-FixedａndParrffinEmbedded），即福爾馬林固定石蠟包埋樣本。由于這種處理方法能夠較長(zhǎng)時(shí)間地保存組織或制備檢驗(yàn)所需的組織標(biāo)本，所以在臨床病理檢驗(yàn)、腫瘤基因檢測(cè)中應(yīng)用廣泛。在世界范圍內(nèi)，大約有數(shù)十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫(kù)中，其中絕大多數(shù)是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理的樣品。FFPE樣本通常代表了珍貴且來(lái)源廣泛的生物醫(yī)學(xué)研究材料，為闡明疾病機(jī)制、回顧性研究等提供了寶貴的資

10 min ，get甲基化研究速成指南2019/05/16: 什么是DNA甲基化DNA甲基化（DNAmethylation）是DNA化學(xué)修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下改變遺傳表現(xiàn)。DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價(jià)鍵結(jié)合一個(gè)甲基基團(tuán)。DNA甲基化的結(jié)果，一般是使甲基化位點(diǎn)的下游基因表達(dá)量變少。圖1：DNA甲基化原理圖為什么研究DNA甲基化DNA甲基化是早發(fā)現(xiàn)的基因表觀修飾方式之一，可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化在維持細(xì)胞正常功能、傳遞基因組印記、胚胎發(fā)育、腫瘤發(fā)生等方面發(fā)揮重要作

小分子化合物專(zhuān)題2019/05/15: 小分子化合物專(zhuān)題一、信號(hào)通路信號(hào)通路是指當(dāng)細(xì)胞里要發(fā)生某種反應(yīng)時(shí)信號(hào)從細(xì)胞外到細(xì)胞內(nèi)傳遞了一種信息，細(xì)胞要根據(jù)這種信息來(lái)做出反應(yīng)的現(xiàn)象。信號(hào)通路（signalpathway）的提出早可追溯到1972年，不過(guò)當(dāng)時(shí)被稱(chēng)為信號(hào)轉(zhuǎn)換（signaltransmission）。1980年M.Rodbell在一篇綜述中提到信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)（signaltransduction），此后該概念就被廣泛使用了。信號(hào)通路是指能將細(xì)胞外的分子信號(hào)經(jīng)細(xì)胞膜傳入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮效應(yīng)的一系列酶促反應(yīng)通路。這些細(xì)胞外的分子信號(hào)（稱(chēng)為配體，l

如何定量低豐度目的基因的表達(dá)2019/01/28: 如何定量低豐度目的基因的表達(dá)（含詳細(xì)解決方法）有時(shí)候，qPCR實(shí)驗(yàn)會(huì)成為阻礙你課題順利開(kāi)展的強(qiáng)勢(shì)攔路虎！看似簡(jiǎn)單的基因表達(dá)量差異驗(yàn)證，當(dāng)遇到低豐富表達(dá)的基因時(shí)，也許就舉步維艱。模板獲取困難導(dǎo)致的RNA提取量少或RNA質(zhì)量不佳，即使選蕞佳的試劑、篩選出良好的引物，也有可能qPCR定量得到的內(nèi)參基因CT值在18-20個(gè)cycle，而目的基因在31-35個(gè)循環(huán)。遇到這種情況，你是怎么解決的呢？qPCR在低豐度表達(dá)基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數(shù)?？煞譃楦哓S度，中等豐度和低豐度。低

dsDNA HS Assay Kit for Qubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)2018/05/23: 行走江湖靠的就是實(shí)力dsDNAHSAssayKitforQubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)——簡(jiǎn)便、靈敏、準(zhǔn)確、穩(wěn)定dsDNAAssayKitforQubit®是Yeasen生物開(kāi)發(fā)的專(zhuān)門(mén)用于Qubit®熒光儀或熒光酶標(biāo)儀的試劑盒，線性范圍0.2-100ng，即使在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下，也可以選擇性的檢測(cè)dsDNA，且耐受較高濃度的蛋白質(zhì)、鹽類(lèi)、洗滌劑等污染物。產(chǎn)品名稱(chēng)產(chǎn)品編號(hào)規(guī)格儲(chǔ)存dsDNAHSAssayKitforQubit®12640ES60100T2-8℃dsDNAHSAssa

文獻(xiàn) | Molecular Plant: 解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎2018/05/23: 文獻(xiàn)|MolecularPlant:解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎倒伏是影響水稻高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的主要限制因素之一。自20世紀(jì)60年代以來(lái)，以作物矮化育種為標(biāo)志的“綠色革命”主要是利用赤霉素合成基因SD1的突變體，培育半矮稈性狀，提高作物（水稻）的抗倒伏能力，使水稻產(chǎn)量得到了大面積的顯著增加。經(jīng)過(guò)多年研究，雖然在水稻中發(fā)現(xiàn)了超過(guò)60個(gè)基因可以導(dǎo)致半矮稈性狀，但這些基因除影響莖稈長(zhǎng)度還影響其它農(nóng)藝性狀，難以應(yīng)用于培育抗倒伏品種。目前，SD1的突變?nèi)匀皇桥嘤景氚捫誀畹闹饕颉Ｓ捎趩我坏目捎没?，抗倒伏性?

淺談DNA磁珠的作用原理2018/05/23: 作為DNA分選磁珠的生產(chǎn)廠商，我們zui經(jīng)常被客戶(hù)問(wèn)到的問(wèn)題就是：高通量測(cè)序（NGS）文庫(kù)制備時(shí)，DNA磁珠為什么可以用來(lái)純化和分選文庫(kù)？在這里我們整理相關(guān)的資料，對(duì)這個(gè)問(wèn)題做簡(jiǎn)單的闡述。分選磁珠的作用原理是基于一種固相載體可逆化固定（SPRI）的分離純化方法。磁珠體系中一般包含：磁珠、DNA、聚乙二醇（PEG）、以及鹽離子等，在一定濃度的PEG和鹽離子環(huán)境中，DNA可吸附到羧基修飾的高分子磁珠表面（即固相載體），該過(guò)程是可逆的，在適當(dāng)條件下，結(jié)合的DNA分子可以被洗脫回收。納米級(jí)別的磁珠表面性

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