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初級(jí)會(huì)員 | 第13年
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院董晨團(tuán)隊(duì)報(bào)道發(fā)燒影響T細(xì)胞分化和自身免疫疾病2020/04/30
發(fā)燒是恒溫動(dòng)物進(jìn)化出的高度保守應(yīng)對(duì)感染和受傷的一種正常生理反應(yīng)。有意思的是,很多變溫動(dòng)物在感染或受傷的過(guò)程中也會(huì)表現(xiàn)出類(lèi)似發(fā)燒的行為,譬如魚(yú)類(lèi)、爬行動(dòng)物和節(jié)肢動(dòng)物等會(huì)主動(dòng)尋找溫暖的水域或地域。通常認(rèn)為適當(dāng)程度的發(fā)燒有助于提高生物體抵抗病原體的能力,提高存活率。研究發(fā)現(xiàn)發(fā)燒通常和先天免疫反應(yīng)聯(lián)系在一起,主要受白細(xì)胞介素(IL)-6的誘導(dǎo)。在免疫系統(tǒng)中,發(fā)燒的一個(gè)主要功能就是增強(qiáng)各類(lèi)天然免疫細(xì)胞的功能,特別是其遷徙能力。也有一些研究表明發(fā)燒同樣可以直接或間接地提升T細(xì)胞的遷徙能力和CD8+T細(xì)胞的殺
蛋白酶磷酸酶抑制劑-癱瘓一酶的神器2020/04/28
蛋白酶磷酸酶抑制劑為何清除蛋白中的磷酸酶及蛋白酶?細(xì)胞中蛋白的磷酸化和去磷酸化是信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化和細(xì)胞凋亡等許多重要的生物學(xué)活動(dòng)的調(diào)控開(kāi)關(guān)。因此在蛋白研究過(guò)程中,對(duì)磷酸酶作用的控制具有重要的生理意義。組織和細(xì)胞中充斥著大量的酶原,經(jīng)裂解后釋放到體外的酶原被充分激活從而開(kāi)始消化周?chē)牡鞍住R虼?,在研究蛋白磷酸化途徑和信?hào)通路的過(guò)程中保護(hù)蛋白磷酸化狀態(tài)是極其關(guān)鍵的。同樣,細(xì)胞裂解后的蛋白粗提物中含有大量的內(nèi)源性蛋白酶,這些酶可以降解細(xì)胞提取物中的蛋白。因此為了防止蛋白純化過(guò)程中目的蛋白不
標(biāo)簽蛋白純化系列2020/04/28
標(biāo)簽蛋白純化系列——快速選擇的純化樹(shù)脂背景描述:對(duì)目的蛋白的功能、結(jié)構(gòu)和相互作用研究時(shí),常常會(huì)用到蛋白純化介質(zhì)。Yeasen為您提供多種優(yōu)良的親和層析介質(zhì),可批量或利用重力進(jìn)行純化,可以、便捷、可靠地從您的樣品中分離蛋白和抗體,為下游應(yīng)用提供良好保證。表1蛋白純化產(chǎn)品性能及應(yīng)用名稱(chēng)性能(/mL填料)粒徑(µm)應(yīng)用NiNTABeads40mg6XHis-taggedprotein45-165用于His標(biāo)簽蛋白的純化,其配體為穩(wěn)定的四配位結(jié)構(gòu),該產(chǎn)品可以耐受比較苛刻的化學(xué)試劑,因此,該產(chǎn)品具有較廣
脂蛋白:研究代謝運(yùn)輸?shù)闹?/a>2020/04/28
脂蛋白—研究代謝運(yùn)輸?shù)闹直尘敖榻B脂蛋白(lipoproteins),與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起形成的脂質(zhì)-蛋白質(zhì)復(fù)合物。脂蛋白中脂質(zhì)與蛋白質(zhì)之間沒(méi)有共價(jià)鍵結(jié)合,多數(shù)是通過(guò)脂質(zhì)的非極性部分與蛋白質(zhì)組分之間以疏水性相互作用而結(jié)合在一起。通常用溶解特性、離心沉降行為和化學(xué)組成來(lái)鑒定脂蛋白的特性。YEASEN(翊圣生物)致力于為診斷試劑公司和廣大科研用戶提供高品質(zhì)的低密度脂蛋白(LDL)和高密度脂蛋白(HDL)。產(chǎn)品應(yīng)用常規(guī)脂蛋白的應(yīng)用乙?;鞍椎膽?yīng)用氧化性脂蛋白的應(yīng)用相關(guān)產(chǎn)品(一)低密度脂蛋白低密度脂蛋白
TUNEL法檢測(cè)細(xì)胞凋亡常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案2020/04/24
TUNEL法檢測(cè)細(xì)胞凋亡常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案大家好,我是你們的實(shí)驗(yàn)小助手小翊,上一期我們講到了細(xì)胞凋亡檢測(cè)的各種手段。這一期我們介紹其中的一種細(xì)胞凋亡檢測(cè)方法--TUNEL法,重點(diǎn)分析TUNEL檢測(cè)細(xì)胞凋亡常見(jiàn)問(wèn)題及解決方案。首先要先了解一下TUNEL染色步驟,如下圖所示。圖1TUNEL染色操作步驟(注:細(xì)胞核染色步驟可選)用TUNEL試劑盒檢測(cè)細(xì)胞凋亡過(guò)程中,需要用到蛋白酶K、熒光素-dUTP、TdT酶等各種試劑,除此以外,還要設(shè)置陽(yáng)性和陰性對(duì)照組,面對(duì)試劑盒各組分的作用以及繁瑣的操作步驟,許多
NGS實(shí)驗(yàn)小助手,純化、分選皆全能2020/04/24
精品推薦|NGS實(shí)驗(yàn)小助手,純化、分選皆全能進(jìn)口磁珠用量大,價(jià)格高,實(shí)驗(yàn)進(jìn)展不下去?翊圣DNA純化分選磁珠,滿足您的需求!DNA///片段純化與分選是高通量測(cè)序中文庫(kù)制備的必要環(huán)節(jié)。目前,市面上的AMPureXP磁珠幾乎占據(jù)半壁江山,但其高昂的價(jià)格令許多測(cè)序公司感到巨大的壓力。翊圣生物匠心研發(fā)專(zhuān)為二代測(cè)序設(shè)計(jì)的簡(jiǎn)單高效、高通量DNA純化分選精品—HieffNGSTMDNASelectionBeads,可無(wú)縫替代AMPureXP產(chǎn)品,不僅性能優(yōu)異,而且質(zhì)優(yōu)價(jià)廉。產(chǎn)品介紹基于SPRI(SolidPh
解讀翊圣生物DNA分選純化磁珠技術(shù)的優(yōu)勢(shì)與市場(chǎng)反饋2020/04/24
國(guó)產(chǎn)NGS試劑破局之路,解讀翊圣生物DNA分選純化磁珠技術(shù)的優(yōu)勢(shì)與市場(chǎng)反饋高通量測(cè)序技術(shù)(NGS)日趨成熟,應(yīng)用廣泛,但在整個(gè)過(guò)程中所使用的儀器、耗材和試劑,仍然還是由國(guó)外壟斷,這對(duì)于已經(jīng)占據(jù)測(cè)序10%產(chǎn)業(yè)規(guī)模,且在增長(zhǎng)黃金期的中國(guó)企業(yè)來(lái)說(shuō)并非長(zhǎng)久之計(jì)。尤其是隨著歐美貿(mào)易保護(hù)、地緣政治以及“再工業(yè)化”的升溫,嚴(yán)重依賴(lài)進(jìn)口不僅導(dǎo)致我們?cè)谡麄€(gè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)中沒(méi)有議價(jià)權(quán),同時(shí)還面臨著隨時(shí)被卡脖子的風(fēng)險(xiǎn)。而今天需要和大家討論的是在NGS中,一個(gè)極其重要的試劑——分選/純化磁珠。*,樣本測(cè)序前需進(jìn)行文庫(kù)制備,制
5 min了解DNA磁珠的前世今生(含結(jié)果分析及FAQ解讀)2020/04/22
磁珠是高通量測(cè)序過(guò)程*產(chǎn)品,通過(guò)磁顆?;钚曰鶊F(tuán)在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理,將樣本中目的片段分離??蓪?shí)現(xiàn)對(duì)核酸樣本的高通量自動(dòng)化操作,廣泛應(yīng)用于基因測(cè)序以及分子診斷領(lǐng)域。背景篇磁珠的發(fā)明構(gòu)想初來(lái)自于挪威科技大學(xué)的化學(xué)家JohnUgelstad,他在1976年以聚苯乙烯為主要材料,制作出均勻磁化的球體粒子。1979年Vogelstein等報(bào)道在高濃度典化鈉存在的條件下,玻璃粉末作為吸附劑用于從瓊脂糖凝膠中提取DNA片段,而后基于硅膠和其他具有親水性表面載體的固相核酸純化技術(shù)廣泛發(fā)展起來(lái)。而
Benzonase Nuclease 全能核酸酶2020/04/22
核酸酶,又稱(chēng)廣譜核酸酶,英文名稱(chēng)BenzonaseNuclease,一種來(lái)源于SerratiaMarcescen的非特異性核酸內(nèi)切酶,可在鏈內(nèi)任意核苷酸間進(jìn)行切割,將核酸*消化成3-8個(gè)堿基長(zhǎng)度的5'-單磷酸寡核苷酸,能夠在非常廣泛的條件下降解所有形式的(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀,天然或變性)DNA和RNA。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步,科學(xué)家對(duì)于效率的要求越來(lái)越高,在消耗同樣的時(shí)間和精力下,他們更愿意選擇快速,的方法。傳統(tǒng)核酸去除主要是超聲法和DNase/RNase酶法,因?yàn)閷?duì)應(yīng)的實(shí)驗(yàn)周期長(zhǎng)、去除效率低,
4h完成mRNA建庫(kù)2020/04/15
4h完成mRNA建庫(kù)是一種怎樣的體驗(yàn)?mRNA-seq不僅可以提供準(zhǔn)確且*靈敏度的量化基因表達(dá),還可以識(shí)別已知的和新的轉(zhuǎn)錄異構(gòu)體、基因融合和其他特征及等位基因特異性表達(dá)。當(dāng)前已迅速成為分析疾病狀況,生物過(guò)程以及轉(zhuǎn)錄組分析的首xuan方法。而文庫(kù)制備是mRNA-seq的關(guān)鍵因素,直接影響測(cè)序質(zhì)量。翊圣生物根據(jù)市場(chǎng)需求,集中專(zhuān)業(yè)研發(fā)人員致力于mRNA建庫(kù)試劑盒的創(chuàng)新研發(fā),重磅推出HieffNGS®MaxUpⅡDual-modemRNA建庫(kù)試劑盒。產(chǎn)品簡(jiǎn)介HieffNGS®MaxUpⅡDual-mod
MaxUpII DNA Library Prep Kit2020/04/15
MaxUpIIDNALibraryPrepKitforIllumina®——建庫(kù)試劑盒中的王1、產(chǎn)品概述HieffNGS®MaxUpIIDNALibraryPrepKitforIllumina®,可用于NGS測(cè)序中DNA樣本文庫(kù)構(gòu)建,采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,改進(jìn)型接頭連接技術(shù),以及具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的高保真酶,顯著提高文庫(kù)轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率,InputDNA范圍為500pg-1μg,適用包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等測(cè)序方
NGS文庫(kù)構(gòu)建產(chǎn)品選擇2020/04/15
NGS文庫(kù)構(gòu)建產(chǎn)品選擇指南YEASEN與NGS高通量測(cè)序是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的革命性創(chuàng)新,大力推動(dòng)了科學(xué)技術(shù)的發(fā)展。Yeasen長(zhǎng)期以來(lái)一直對(duì)高通量測(cè)序技術(shù)保持高度關(guān)注。自2009年成立以來(lái),公司致力于分子酶的創(chuàng)新開(kāi)發(fā),結(jié)合自身多年分子酶研發(fā)經(jīng)驗(yàn),集結(jié)了在基因組學(xué)和生物信息學(xué)等領(lǐng)域有豐富經(jīng)驗(yàn)的科研人員組建了高通量測(cè)序研發(fā)團(tuán)隊(duì),成功推出了高通量測(cè)序上游樣本文庫(kù)制備的完整產(chǎn)品線。不僅可以提供的建庫(kù)試劑盒,同時(shí)還可以根據(jù)客戶的需求定制開(kāi)發(fā)測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品。廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)檢測(cè)、科學(xué)研究等各個(gè)領(lǐng)域。公司注重產(chǎn)品品
基因治療領(lǐng)域的*--mRNA疫苗2020/04/10
基因治療領(lǐng)域的*--mRNA疫苗據(jù)路透社3月15日?qǐng)?bào)道:美國(guó)政府正試圖說(shuō)服疫苗研發(fā)的德國(guó)公司CureVac搬遷到美國(guó)并壟斷其疫苗生產(chǎn),而德國(guó)政府希望該公司能留在本國(guó)。那么,CureVac公司擁有什么重要的東西竟讓兩個(gè)國(guó)家政府直接出面進(jìn)行爭(zhēng)奪?答案就是——mRNA疫苗制備技術(shù)。什么是mRNA疫苗mRNA疫苗是將RNA在體外進(jìn)行相關(guān)的修飾后傳遞至機(jī)體細(xì)胞內(nèi)表達(dá)并產(chǎn)生蛋白抗原,從而導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生針對(duì)該抗原的免疫應(yīng)答,進(jìn)而擴(kuò)大機(jī)體的免疫能力[1,3]。圖1:直接注射mRNA疫苗效果示意圖[2]mRNA疫苗的
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)做不好,是不是引物出了問(wèn)題2020/04/09
實(shí)驗(yàn)室常用到的實(shí)驗(yàn):逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)人員通過(guò)體外模擬病毒復(fù)制過(guò)程,以提取的RNA為模板,使用逆轉(zhuǎn)錄酶催化,合成出與RNA互補(bǔ)的cDNA鏈。終構(gòu)建cDNA文庫(kù),并從中篩選所需的靶標(biāo)基因。BUT!小伙伴們做逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí),1)有沒(méi)有深究過(guò)RNA逆轉(zhuǎn)錄出的cDNA能不能真實(shí)反映出基因表達(dá)信息?2)做實(shí)驗(yàn)時(shí),有沒(méi)有發(fā)生過(guò)內(nèi)參做的很好,目的基因做不出的情況?如果有發(fā)生上述情況,那么需要重新評(píng)估逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果的有效性。逆轉(zhuǎn)錄結(jié)果有效性的評(píng)定逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果有效性的評(píng)定重要的是盡可能反映樣本中原始RNA模板的信息,
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)做不好,是不是引物出了問(wèn)題?2020/04/09
實(shí)驗(yàn)室常用到的實(shí)驗(yàn):逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)人員通過(guò)體外模擬病毒復(fù)制過(guò)程,以提取的RNA為模板,使用逆轉(zhuǎn)錄酶催化,合成出與RNA互補(bǔ)的cDNA鏈。終構(gòu)建cDNA文庫(kù),并從中篩選所需的靶標(biāo)基因。BUT!小伙伴們做逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí),1)有沒(méi)有深究過(guò)RNA逆轉(zhuǎn)錄出的cDNA能不能真實(shí)反映出基因表達(dá)信息?2)做實(shí)驗(yàn)時(shí),有沒(méi)有發(fā)生過(guò)內(nèi)參做的很好,目的基因做不出的情況?如果有發(fā)生上述情況,那么需要重新評(píng)估逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果的有效性。逆轉(zhuǎn)錄結(jié)果有效性的評(píng)定逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果有效性的評(píng)定重要的是盡可能反映樣本中原始RNA模板的信息,
雙判定標(biāo)準(zhǔn)判定qPCR擴(kuò)增特異性,提升Ct值真實(shí)性2020/04/09
qPCR實(shí)驗(yàn)易做,但數(shù)據(jù)分析并非想象中的那么容易!數(shù)據(jù)分析的好與壞,極大程度上依賴(lài)于qPCR原始結(jié)果的質(zhì)量。qPCR結(jié)果的評(píng)價(jià)指標(biāo)?溶解曲線,是qPCR結(jié)果判定的第—要素。它的作用是判定目的基因是否得到擴(kuò)增。理論上,當(dāng)反應(yīng)體系中僅是目標(biāo)基因的擴(kuò)增,才是有效擴(kuò)增。?標(biāo)準(zhǔn)曲線,是qPCR結(jié)果判定的金標(biāo)準(zhǔn)。(在溶解曲線判定為特異性擴(kuò)增后)它的作用是測(cè)定引物的擴(kuò)增效率及試劑的檢測(cè)上下限。根據(jù)文章發(fā)表對(duì)于qPCR數(shù)據(jù)的要求,擴(kuò)增效率應(yīng)在90-110%。?擴(kuò)增曲線,是直接生成qPCR定量的數(shù)據(jù),即Ct值。從
qPCR進(jìn)階攻略—帶你玩轉(zhuǎn)儀器設(shè)置2020/04/09
熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)是分子實(shí)驗(yàn)室常用的一項(xiàng)技術(shù)。持續(xù)關(guān)注小翊的應(yīng)該都掌握了高質(zhì)量cDNA的獲取方法,引物設(shè)計(jì)指南以及反應(yīng)體系的配制技巧(還未get的小伙伴戳文末鏈接),然而上機(jī)時(shí),發(fā)現(xiàn)和別人的反應(yīng)條件不一致卻又不敢動(dòng)儀器?本期小翊將帶你玩轉(zhuǎn)qPCR儀器的設(shè)置!目前市面上的qPCR儀器種類(lèi)五花八門(mén),但基本上儀器的設(shè)置都相對(duì)一致。我們以ABI7500為例進(jìn)行介紹。反應(yīng)板設(shè)置實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇:我們將實(shí)驗(yàn)命名為“Yeasen”,進(jìn)行“Quantitation:ΔΔCt”實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)方法選擇:如選用SYBRGre
小翊教你做雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)2020/04/08
背景介紹熒光素酶生物檢測(cè)技術(shù)誕生于1990年,已有供了更可靠的研究30年的發(fā)展史。單熒光素酶檢測(cè)系統(tǒng)到雙熒光素酶檢測(cè)系統(tǒng)的發(fā)展,為科研人員提供了更為嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)手段。雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)在原有的基礎(chǔ)上引入了海腎報(bào)告基因,可以排除不同組之間細(xì)胞生長(zhǎng)狀況、細(xì)胞數(shù)目以及轉(zhuǎn)染效率帶來(lái)的干擾,起到校正的作用,從而使實(shí)驗(yàn)結(jié)果更為可靠。其發(fā)光原理如下圖1。圖1雙熒光素酶發(fā)光原理實(shí)驗(yàn)方案將靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件或5’啟動(dòng)子區(qū)克隆在Fireflyluciferase基因的上游,或把3’-UTR區(qū)或lncRNA結(jié)
用數(shù)據(jù)說(shuō)話,教你做雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)2020/04/08
你是否正在驗(yàn)證miRNA與lncRNA的作用機(jī)制?是否在分析確認(rèn)miRNA的靶基因?在研究轉(zhuǎn)錄因子和啟動(dòng)子的實(shí)驗(yàn)中,你是否想確定結(jié)合位點(diǎn)的序列?這些問(wèn)題都可以用雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)來(lái)嘗試解決。雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)介紹基于熒光素酶(luciferase)的發(fā)光原理,科學(xué)家發(fā)明了雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括螢火蟲(chóng)熒光素酶(Fireflyluciferase)和海腎熒光素酶(Renillaluciferase)。兩者可催化各自的底物發(fā)生氧化作用產(chǎn)生生物熒光,產(chǎn)生的熒光數(shù)值大小即表
這有一份 FFPE 樣本建庫(kù)的檔案,還不趕緊 Pick?2020/04/02
■什么是FFPE?FFPE(Formalin-FixedandParrffinEmbedded),即福爾馬林固定石蠟包埋樣本。由于這種處理方法能夠較長(zhǎng)時(shí)間地保存組織或制備檢驗(yàn)所需的組織標(biāo)本,所以在臨床病理檢驗(yàn)、腫瘤基因檢測(cè)中應(yīng)用廣泛。在世界范圍內(nèi),大約有數(shù)十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫(kù)中,其中絕大多數(shù)是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理的樣品。FFPE樣本通常代表了珍貴且來(lái)源廣泛的生物醫(yī)學(xué)研究材料,為闡明疾病機(jī)制、回顧性研究等提供了寶貴的資源,但是由于樣本制備以及儲(chǔ)存等多方面的原因,F(xiàn)F
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