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上海源葉生物科技有限公司
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人工生命是非生命手段對生命基本特征的模擬2011/01/25
人工生命是通過把隱藏在生命現(xiàn)象背后的基本的、動態(tài)的原理抽象出來,并在其他物理媒介(如計算機)上重現(xiàn)這一過程,使之可以進行全新類型的實驗操作和檢驗,從而理解生命??傮w上說,人工生命的核心是利用適當(dāng)?shù)姆巧^程手段,通過對生命的基本特征(新陳代謝、生長、繁殖、遺傳、變異、學(xué)習(xí)、進化等)進行模擬,以深化人們對生命現(xiàn)象的認識。人工生命的研究手段大致有3種:軟件法、硬件法與濕件法。其中,軟件法是指以計算機程序作為模擬生命過程的載體;硬件法是通過機械和電子的手段再現(xiàn)生命的某些屬性;濕件法則是指采用化學(xué)或物理
轉(zhuǎn)基因食品的生物檢測技術(shù)2011/01/25
目前實驗室研究的檢測技術(shù)可分為三大類:免疫學(xué)方法、核酸探針法和分子標(biāo)記法,主要是檢測食品或原料中重組DNA或其表達產(chǎn)物如蛋白質(zhì)等。蛋白檢測—ELISA分析法適用于無須加工的原料性食品,但對于加工品則有局限性,因為重組基因產(chǎn)物會因加工處理而失活、分解或消失,使檢測的不確定性增加。DNA在加工中穩(wěn)定性較好,因此加工性轉(zhuǎn)基因食品的檢測方法常常針對DNA設(shè)計。適用于重組DNA的檢測方法有DNA雜交、AFLP和PCR等。與ELISA相比,PCR靈敏度高,可用于微量分析和較多的加工品。
人類基因組研究--大片段外源DNA克隆體系2011/01/25
(1)酵母人工染色體克隆體系(YAC)這種克隆體系是20世紀80年代末發(fā)展起來的,并于1990年底漸趨完善的大片段外源DNA克隆體系。插入YAC載體的外源DNA片段可達200l000kb甚至更多,并能穩(wěn)定復(fù)制。現(xiàn)在YAC已成為構(gòu)建復(fù)雜基因組的有力手段。(2)黏??寺?,n噬菌體和細菌人工染色體黏粒克隆的出現(xiàn)早于YAC,其主要特點是插入的外源片段比入噬菌體DNA大得多。因此在篩選基因文庫時可以減少一半工作量。P1噬菌體的溶源狀態(tài)奇特,不整合到宿主的染色體上,像質(zhì)粒一樣作為一個自主復(fù)制單位游離于宿主染
炭疽的臨床特征2011/01/19
1.牛潛伏期1~5天。zui急性者表現(xiàn)突然倒地,呼吸困難,結(jié)膜發(fā)紺,全身戰(zhàn)栗,心悸亢進,天然孔出血,數(shù)小時內(nèi)死亡。急性者體溫升高,精神沉郁,食欲減退,反芻減弱或停止,黏膜發(fā)紺或有小出血點。初期便秘,接著就腹痛腹瀉,便中帶血,尿呈暗紅色,孕牛流產(chǎn)。瀕死期體溫下降,呼吸困難,痙攣發(fā)抖,常于1—2日內(nèi)死亡。亞急性者病程較長,病情較緩和,多于體表、直腸、口腔黏膜等處發(fā)生炭疽癰。初期硬團,有熱有痛,以后熱痛消失,有時壞死,形成潰瘍。牛舌腫大,或有出血和潰瘍即“木舌癥”。2.羊綿羊zui易感,多為zui急性
結(jié)核菌素點眼反應(yīng)2011/01/19
牛結(jié)核菌素,每次進行2次反應(yīng),間隔3-5天?!?)方法點眼前,對兩眼作詳細檢查,正常時方可點眼,有眼病或結(jié)膜不正常者,不可作點眼檢疫。結(jié)核菌素一般點于左眼,左眼有眼病時可點于右眼,但須在記錄上注明:用量為3-5滴,約o.2一o.3ml。點眼后。注意將牛拴好,防止風(fēng)沙侵入眼內(nèi),避免陽光直射牛頭部以及牛與周圍物體摩擦。(2)觀察反應(yīng)點眼后,于3h、6h、9h各觀察1次,必要時可觀察24h的反應(yīng)。觀察時,注意兩眼的結(jié)膜與眼瞼腫脹的狀態(tài),流淚及分泌物的性質(zhì)和量的多少,由于結(jié)核菌素而引起的食欲減少或停止
豬丹毒分子生物學(xué)診斷技術(shù)2011/01/19
日本Okayama大學(xué)的研究者們建立了檢測豬丹毒的PCR方法(1999)。常規(guī)細菌培養(yǎng)檢測豬丹毒至少要3天,鑒定血清型大約要lo天,而這種PCR法可在5h內(nèi)完成。它使用兩步擴增法,先用高度特異性引物組M0101-M0102進行初步擴增之后,再添加4種特異性寡核苷酸引物組對4種不同血清型豬丹毒的16SrRNA序列進行擴增。rRNA基因簇包括16SrRNA、23SrRNA、5SrRNA、下游非編碼區(qū)。對該簇編碼的DNA序列進行測定,以設(shè)計種特異性PCR檢測系統(tǒng)的引物。豬紅斑丹毒絲菌2型、3型、18型
檢測大腸桿菌的PCR技術(shù)2011/01/19
中美學(xué)者合作,對3.3kb的DNA探針進行了序列分析,發(fā)現(xiàn)其編碼EHEC溶血素AB基因,此基因與已發(fā)表的泌尿道大腸桿菌等的溶血素在DNA序列和氨基酸序列有所不同,是EHEC*的,并以此為基礎(chǔ),發(fā)展了PCR檢測方法。此法特異、敏感、快速,可在3—4h左右出結(jié)果。Brian等針對VT基因A亞單位分別設(shè)計出SLTl引物和SLT2引物和雜交用的寡核苷酸探針。兩對引物可同時擴增EHEC的SLTl和SLT2,先后擴增出370bp和283bp的產(chǎn)物,并用放射性探針予以證實,而非EHEC擴增為陰性。這種方法還可
DNA限制酶批注討論2011/01/18
a.限制酶:可購自RocheMolecularBiochemicals(即以前的BoehringerMannheimBiochemicals),Invitrogen(即以前的LifeTechnologies或GibcoBRL),NewEnglandBioLabs(BioLabs)或其它公司。b.限制酶的貯存與取用:反復(fù)解凍與凍結(jié)是任何酵素的大忌,因此不可存放于無霜冰箱中。大部份限制酶購買來時即保存在50%glycerol中,存放在-20℃時不會凍結(jié)。有些限制酶相當(dāng)不穩(wěn)定,必須存放在-70℃,請避
Silica gel吸附法分離與純化DNA片段2011/01/18
藥品試劑:經(jīng)BamHI及HindIII作用的pBlueGus及pQE31含EtBr的1.2%12-wellagarosegel1×TAE電泳緩沖液QIAquickGelExtractionKit(Qiagen),內(nèi)含:QIAquickspincolumn(管柱底部為silicagelmembrane)BufferQGBufferPEBufferEB(10mMTris-HCl,pH8.5)2mL收集管TE-8.0方法步驟:1)經(jīng)BamHI及HindIII作用的pBlueGus及pQE31,置于65
電穿孔法進行質(zhì)體的轉(zhuǎn)形=2011/01/18
儀器用具:37℃培養(yǎng)箱及冰浴Electroporationcuvette(electrodegap,0.1cm)Electroporator(Bio-Rad,IBIgeneZapper或其它廠牌)藥品試劑:無菌水(置冰浴中)10%glycerol(置冰浴中)SOB液體培養(yǎng)基SOB固體培養(yǎng)基SOC液體培養(yǎng)基SOC/Amp固體培養(yǎng)基大腸桿菌JM109Ligationmixtures方法步驟:菌體的處理:1)進行轉(zhuǎn)形實驗的前16~20h,將菌種JM109接種在SOB固體培養(yǎng)基上,并在37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)
電穿孔法進行質(zhì)體的轉(zhuǎn)形\2011/01/18
器用具:37℃培養(yǎng)箱及冰浴Electroporationcuvette(electrodegap,0.1cm)Electroporator(Bio-Rad,IBIgeneZapper或其它廠牌)藥品試劑:無菌水(置冰浴中)10%glycerol(置冰浴中)SOB液體培養(yǎng)基SOB固體培養(yǎng)基SOC液體培養(yǎng)基SOC/Amp固體培養(yǎng)基大腸桿菌JM109Ligationmixtures方法步驟:菌體的處理:1)進行轉(zhuǎn)形實驗的前16~20h,將菌種JM109接種在SOB固體培養(yǎng)基上,并在37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
Southern 轉(zhuǎn)印分析\2011/01/18
在膠體中的DNA可利用毛細現(xiàn)象的作用將DNA牽引轉(zhuǎn)印至覆蓋在膠片上的濾膜,經(jīng)烘烤或UV照射后,可使DNA固定在膜上,以進行探針的雜合(hybridization)反應(yīng)。儀器用具:玻璃缸;玻璃板或吸水海綿;Crosslinker(Stratalinker1800,Stratagene)藥品試劑:10×SSC(1.5MNaCl;0.15Msodiumcitrate)或20×SSC變性溶液(1.5MNaCl;0.5NNaOH)中和溶液(1MTris-Cl;1.5MNaCl,pH7.5)Nylonmem
以DIG 標(biāo)定核酸探針02011/01/18
DNA探針一般可以用32P,35S或非放射性物質(zhì)如biotin及digoxigenin(DIG)加以標(biāo)定;標(biāo)定時利用DNA聚合酶的活性,在DNA聚合反應(yīng)中,另加入[α-32P]dATP,[α-32P]dCTP或DIG-11-dUTP等標(biāo)定物質(zhì),所合成出來的即是被標(biāo)定的核酸片段。目前常見的方法包括nicktranslation,randompriming與polymerasechainreaction(PCR)等。若須對DNA進行endlabeling時,可以進行kinase或filling-in
(Random priming)2011/01/18
DNA聚合酶要進行DNA聚合反應(yīng)時一定要有引子(primer),因為它只能以引子所提供的3’-OH為起始點進行延伸(extension)的工作,而不能就地重新合成新的DNA(denovosynthesis)。一般實驗常以人工合成的寡核苷酸為引子進行DNA聚合反應(yīng),這時固然可以根據(jù)已知序列設(shè)計核酸引子,但也可以采用逢機引子(randomprimers)。所謂逢機引子即其序列為逢機序列,不經(jīng)特別設(shè)計,目前應(yīng)用zui廣者是以自動化機器所合成的、六到八個核苷酸長的寡核苷酸混合物;反應(yīng)進行中若有任何一條逢
制備電泳分析所需的RNA 樣本2011/01/18
制備電泳分析所需的RNA樣本1)取出8支1.5mL微量離心管,分別標(biāo)示為U-1,U-2,I-1,I-2,#1,#2,#3及#4,并根據(jù)下表所示依序加入各項試劑(體積單位為μL)。??U-1,U-2,I-1及I-2分別為大腸桿菌所分得的RNA,#1,#2,#3及#4分別是胞外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)所得到的RNA。2)混合均勻并離心數(shù)秒后,放置于65℃恒溫水槽作用15min。3)將作用完的微量離心管移置于冰浴中。4)離心數(shù)秒后,再將離心管放回于冰浴中,并于各離心管分別加入2μL的formaldehydegello
北方雜合反應(yīng)2011/01/18
北方雜合反應(yīng)的步驟主要包括:(1)加入核酸探針,使與固定于尼龍膜上的特定RNA進行雜合反應(yīng),及(2)待雜合反應(yīng)結(jié)束后以含鹽緩沖液與SDS洗掉非專一性結(jié)合于尼龍膜上的核酸探針。進行反應(yīng)時應(yīng)注意下列幾個問題:(1)實驗操作過程仍應(yīng)盡可能避免RNase的污染;(2)反應(yīng)前應(yīng)先進行雜合前置反應(yīng)(prehybridization),以便減少核酸探針與尼龍膜的間的非專一性結(jié)合反應(yīng);(3)如果所使用的核酸探針是以randompriming或PCR等方法所制備的雙股DNA探針,使用前務(wù)必先加熱變性;(4)選用適
乳膠顆粒凝集試驗(LPAT)檢測與鑒定熱不穩(wěn)定腸毒素2011/01/12
由Finkelstein等建立,方法如下。①乳膠敏化取lOlL羊抗人源LT-I血清與19OμlpH8、2甘氨酸緩沖鹽水混勻,再加等體積乳膠制劑,混勻,37℃水浴孵育2h,每15min振搖1次,然后加入用上述緩沖液稀釋的O.1%牛血清白蛋白600uL,3Orain而后即可使用。②待檢菌液制備從MacC或EMB或;HE等瓊脂上挑取待檢菌落,在裝有3Ortl的20000U/ml多黏菌素B的Tris-NaCl緩沖液的指形管內(nèi)制成菌懸液,37℃水浴溫育5~3Omin(視菌液濃度而定),離心沉淀細胞,上清液
沙門菌病的血清學(xué)檢測方法2011/01/12
(1)雞白痢全血平板凝集試驗用于雞白痢的凈化檢疫,現(xiàn)場采集雞全血,與雞白痢沙門菌標(biāo)準(zhǔn)菌株制備的抗原進行凝集試驗,根據(jù)凝集程度判斷試驗結(jié)果。該方法省時節(jié)力,易于操作,但是特異性和敏感性低。(2)競爭ELISA檢測方法以特定血清型的沙門菌作為包被抗原,利用酶標(biāo)O抗原特異性單抗酶建立的競爭ELISA方法檢測沙門菌抗體。殷月蘭等利用焦新安研制的09單抗,建立了豬霍亂抗體競爭ELISA檢測方法,與平板凝集試驗(PAT)同時對506份血清樣品進行了豬霍亂抗體檢測,PAT的檢出率為3.60%,ELISA檢出率
金葡菌特異性鑒別基因2011/01/12
在金葡菌的檢測方面,近年來很多學(xué)者逐漸探索了一些有很強特異性的鑒別基因,主要包括如下幾種。a.耐熱核酸酶基因(heatstablenuelease,nuc)。耐熱核酸酶(thermostablenuclease,TNase)是金葡菌的特異性酶,通過檢測TNase酶活性以鑒定金葡菌通常有較好的專一性和準(zhǔn)確性,但也存在一些非金葡菌株可檢測到該酶活性的例子,其原因尚不清楚,可能是由于其可產(chǎn)生與TNase活性相似的酶。編碼酶蛋白的nuc基因已全部定序。通過nuc基因的特異擴增來檢測金葡菌已被證實具有非常
副溶血性弧菌檢測的免疫學(xué)方法2011/01/12
免疫學(xué)方法特異性強、靈敏度高、易于觀察、應(yīng)用廣泛。血清學(xué)反應(yīng)是zui基本的免疫學(xué)反應(yīng),主要用于細菌分型。目前,通過血清學(xué)反應(yīng),V.p可分為13種O血清型、71種K血清型。正確的分型為流行病學(xué)調(diào)查和臨床用藥提供依據(jù)。但此反應(yīng)只能大概區(qū)分不同地區(qū)和來源的菌株,而且由于抗原位點受環(huán)境等因素的影響易發(fā)生突變,出現(xiàn)新的血清型時,以現(xiàn)有的血清檢測就會漏檢。目前,應(yīng)用zui廣泛的免疫學(xué)方法是酶聯(lián)免疫吸附法(enzymelinkedimmunosorbentassay,ELISA)。該方法從抗體的包被到酶聯(lián)顯色
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